52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3371 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  862    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  49 
 
 
413 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  59.73 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  45.52 
 
 
423 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  53.72 
 
 
448 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  44.21 
 
 
409 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  35.43 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  38.46 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  34.98 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  34.82 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  34.82 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  34.98 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  34.82 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  34.98 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  35.91 
 
 
380 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  41.12 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  34.68 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  33.76 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  28.73 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  32.14 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  28.73 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  28.73 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  30.6 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  31.21 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  29.53 
 
 
655 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  32.95 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  33.01 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  27.11 
 
 
540 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  27.53 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  26.74 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  28 
 
 
588 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  28.11 
 
 
458 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  30.29 
 
 
580 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  27.69 
 
 
527 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.73 
 
 
499 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  28.04 
 
 
783 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  27.78 
 
 
468 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  27.73 
 
 
529 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  27.73 
 
 
529 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  27.46 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  30 
 
 
768 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  36.04 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  36.04 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  31.15 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  23.05 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  28.2 
 
 
533 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  25.5 
 
 
526 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  26.73 
 
 
542 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  26.73 
 
 
542 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  26.73 
 
 
542 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>