42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3351 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  100 
 
 
214 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  70.09 
 
 
211 aa  297  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  84.11 
 
 
214 aa  290  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  73.4 
 
 
211 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  72.91 
 
 
211 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  72.91 
 
 
211 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  62.09 
 
 
216 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  44.31 
 
 
257 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  44.8 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  41.59 
 
 
226 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  41.98 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  45.25 
 
 
221 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  36.24 
 
 
243 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  50.9 
 
 
220 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  37.38 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  28.14 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.57 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  31.36 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  43.14 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  44 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  33.85 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  26.96 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  38.03 
 
 
302 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  23.79 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  28.57 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  28.19 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  26.88 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  25.32 
 
 
228 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
228 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
228 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  25.44 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  28.51 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  28.9 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  40.28 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  25 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  22.35 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  46.67 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  27.75 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  27.75 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  29.06 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>