84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3247 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  88.4 
 
 
250 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  65.86 
 
 
256 aa  346  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  70.8 
 
 
259 aa  343  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  64.66 
 
 
256 aa  319  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  46.77 
 
 
408 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  48.39 
 
 
412 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  45.2 
 
 
251 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  43.6 
 
 
402 aa  218  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  47.98 
 
 
405 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  47.15 
 
 
397 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  45.97 
 
 
409 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  46.77 
 
 
423 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  46.56 
 
 
406 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  40.96 
 
 
405 aa  212  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  46.37 
 
 
410 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  46.37 
 
 
407 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  47.18 
 
 
406 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  45.75 
 
 
409 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  45.56 
 
 
406 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  41.7 
 
 
413 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  44.35 
 
 
405 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  43.95 
 
 
406 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  41.77 
 
 
415 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  44.62 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  44.22 
 
 
257 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  44.18 
 
 
410 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  43.37 
 
 
410 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  48.59 
 
 
418 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  44.76 
 
 
407 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  43.95 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  48.68 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  49.57 
 
 
408 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  49.14 
 
 
408 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  39.68 
 
 
258 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
256 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  34.4 
 
 
259 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  36.76 
 
 
411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  42.36 
 
 
145 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.17 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.81 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.32 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.4 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  26.84 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  27.87 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.26 
 
 
305 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  24.76 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.25 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  24.48 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  35.77 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.53 
 
 
313 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  24.88 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  27.05 
 
 
269 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  31.21 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.71 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  30.5 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.79 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  25.4 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  24.18 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  35.77 
 
 
467 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2330  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000212255 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  32.14 
 
 
352 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  24.75 
 
 
305 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  25.48 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.83 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  23.2 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.89 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  24.58 
 
 
314 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  21.48 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  30.37 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  23.01 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  21.09 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  31.85 
 
 
968 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  24.23 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  33 
 
 
290 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  22.34 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
340 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  26.57 
 
 
580 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>