More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3236 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3236  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21765  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5684  alpha/beta hydrolase fold  81.39 
 
 
274 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5305  alpha/beta hydrolase fold  81.75 
 
 
274 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5394  alpha/beta hydrolase fold  81.75 
 
 
274 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.117784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5859  alpha/beta hydrolase fold  81.75 
 
 
274 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 
289 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  44.2 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.86 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
285 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  41.43 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  39.63 
 
 
285 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  30 
 
 
292 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  35.53 
 
 
276 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4132  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
280 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0857  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.29 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00184237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  28.22 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.78 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.97 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.97 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.97 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  22.34 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.61 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  21.55 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  22.61 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  25.8 
 
 
314 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  23.34 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  28.47 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.51 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 
316 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.76 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  22.74 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  27.31 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
363 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  23.94 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  21.54 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  19.85 
 
 
263 aa  52  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  26.17 
 
 
301 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  21.5 
 
 
289 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
291 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
274 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.43 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  20.46 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  21.5 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>