More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3225 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.16 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.73 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  35.57 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  44.83 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  29.76 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.74 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
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NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
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