More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3165 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  89.11 
 
 
257 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  71.67 
 
 
249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  67.63 
 
 
246 aa  341  5.999999999999999e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  66.39 
 
 
246 aa  335  2.9999999999999997e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  63.22 
 
 
247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  64.88 
 
 
247 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  65.69 
 
 
240 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  65.29 
 
 
244 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  64.44 
 
 
240 aa  315  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  64.08 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.02 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  64.05 
 
 
246 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  63.18 
 
 
241 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  64.71 
 
 
249 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  63.18 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.76 
 
 
240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.6 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  63.6 
 
 
241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  63.6 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  61.09 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  64.02 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  64.02 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  63.6 
 
 
241 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  64.02 
 
 
243 aa  305  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.67 
 
 
244 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.34 
 
 
240 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.09 
 
 
240 aa  304  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  63.18 
 
 
240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  58.69 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.25 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  63.6 
 
 
241 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.91 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  63.33 
 
 
257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  63.6 
 
 
243 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
244 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.09 
 
 
246 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.76 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.76 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.73 
 
 
250 aa  301  7.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
240 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61 
 
 
245 aa  300  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  60.25 
 
 
248 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  62.34 
 
 
241 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
240 aa  299  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.67 
 
 
240 aa  299  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.25 
 
 
244 aa  299  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  298  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  298  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
258 aa  299  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  298  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.41 
 
 
251 aa  298  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.68 
 
 
246 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  298  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  61.98 
 
 
244 aa  298  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  297  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.9 
 
 
242 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  297  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  61.92 
 
 
241 aa  296  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  59.46 
 
 
256 aa  296  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
240 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  61.51 
 
 
242 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  62.76 
 
 
241 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  61.51 
 
 
242 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.95 
 
 
273 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  59 
 
 
242 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 
244 aa  295  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.09 
 
 
247 aa  295  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.92 
 
 
244 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.59 
 
 
255 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  59.84 
 
 
252 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.51 
 
 
244 aa  295  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  60.25 
 
 
240 aa  294  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.67 
 
 
246 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.83 
 
 
247 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.25 
 
 
240 aa  293  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
246 aa  293  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.44 
 
 
240 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.16 
 
 
251 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.75 
 
 
243 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.58 
 
 
243 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  60.49 
 
 
244 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  59 
 
 
240 aa  291  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
242 aa  291  7e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 
243 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.63 
 
 
249 aa  291  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  53.11 
 
 
274 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
244 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  54.47 
 
 
258 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  54.47 
 
 
258 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
242 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  62.5 
 
 
244 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  56.73 
 
 
249 aa  289  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>