58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3119 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  225  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  97.3 
 
 
111 aa  198  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  93.69 
 
 
112 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  93.69 
 
 
112 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  93.69 
 
 
112 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  92.79 
 
 
111 aa  191  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  88.89 
 
 
111 aa  172  2e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  76.58 
 
 
114 aa  150  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  63.64 
 
 
113 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  71.74 
 
 
114 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  63.64 
 
 
113 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  73.91 
 
 
114 aa  140  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  61.26 
 
 
114 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  58.88 
 
 
214 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  62.73 
 
 
114 aa  139  1e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  69.09 
 
 
113 aa  139  2e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  58.88 
 
 
116 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  6.81612e-08  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  60.91 
 
 
112 aa  137  4e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  59.29 
 
 
129 aa  132  2e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  59.46 
 
 
114 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  55.86 
 
 
114 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  8.73131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  53.27 
 
 
114 aa  115  2e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  59.18 
 
 
127 aa  113  8e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  50.47 
 
 
169 aa  112  1e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  51.38 
 
 
115 aa  112  2e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21142e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  51.38 
 
 
115 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  49.53 
 
 
128 aa  108  2e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  49.53 
 
 
116 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  54.55 
 
 
114 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  51.58 
 
 
114 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  49.53 
 
 
114 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  53.85 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  52.29 
 
 
117 aa  97.1  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  51.11 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  48.35 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  47.62 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  81.6  3e-15  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  31.78 
 
 
119 aa  63.5  9e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  39.09 
 
 
115 aa  59.7  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.1145e-08  hitchhiker  3.21005e-05 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  33.02 
 
 
113 aa  57  8e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  37 
 
 
118 aa  56.6  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  35.51 
 
 
116 aa  55.8  2e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  34.91 
 
 
125 aa  56.2  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.13588e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  35.35 
 
 
113 aa  55.1  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  32.71 
 
 
115 aa  54.7  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  33.01 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  32.08 
 
 
123 aa  53.5  9e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  32.08 
 
 
123 aa  50.4  8e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  31.91 
 
 
114 aa  50.1  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  37.76 
 
 
102 aa  49.7  1e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  36.11 
 
 
115 aa  49.3  2e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  35.79 
 
 
115 aa  47.4  6e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  35.44 
 
 
95 aa  47  9e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  36.26 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  33.72 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  30 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  33.02 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>