More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3073 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00965194  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3453  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  83.11 
 
 
148 aa  248  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.879628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  69.18 
 
 
153 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  69.18 
 
 
153 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  70.14 
 
 
153 aa  199  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3513  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  59.26 
 
 
142 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3450  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  55.56 
 
 
146 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2020  protein of unknown function UPF0074  47.68 
 
 
177 aa  128  2e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3203  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50 
 
 
143 aa  125  2e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22810  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  50.75 
 
 
149 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.489543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  55.48 
 
 
155 aa  119  1e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0669  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.95 
 
 
149 aa  117  4e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.416555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0358  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  53.85 
 
 
151 aa  115  2e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.28 
 
 
143 aa  115  2e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03520  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  48.15 
 
 
157 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.73 
 
 
149 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3804  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.7 
 
 
141 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.48 
 
 
155 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.52 
 
 
161 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  40.13 
 
 
175 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  41.67 
 
 
141 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  41.67 
 
 
141 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  41.67 
 
 
141 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  40.91 
 
 
162 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  40.91 
 
 
162 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3032  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.76 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.73 
 
 
150 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  40.28 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 
163 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.15 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  40.15 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.94 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  1.29464e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  36.62 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  38.93 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  40.58 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  39.86 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.08 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  43.08 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  38.69 
 
 
141 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3702  hypothetical protein  37.93 
 
 
151 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
172 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  38.69 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.83 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  35.92 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  39.39 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  35.92 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.53 
 
 
150 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.73 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.16 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.67 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  37.59 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.4 
 
 
172 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.38 
 
 
171 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  36.5 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  2.82304e-08 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.26 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.1 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.1 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.49 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  35.61 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.96 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.03 
 
 
166 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.44 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  32.59 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3365  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.98 
 
 
188 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312723  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.46 
 
 
167 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.35 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.03 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.03 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.67573e-11 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.03 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.03 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.76 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  33.77 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.53 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  31.39 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.26 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.62 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.23 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.08 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.83142e-07 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.23 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2865  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.85 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253756  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.04 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  31.39 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.46 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.25 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.56 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.93 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.99058e-08  hitchhiker  2.96889e-09 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.39 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
151 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.64 
 
 
149 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>