108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3064 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  100 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  85.42 
 
 		 304 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  80 
 
 		 277 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  80 
 
 		 277 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  80 
 
 		 277 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  77.66 
 
 		 278 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  60.42 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  64.91 
 
 		 297 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  57.63 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  58.69 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  56.98 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  53.16 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  56.72 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  53.49 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  51.55 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  54.23 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  51.53 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  54.02 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  52.83 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  51.54 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  51.92 
 
 		 311 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  52.47 
 
 		 266 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  51.14 
 
 		 280 aa  254  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  51.72 
 
 		 273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  52.85 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  52.27 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  52.09 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  47.1 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  48.55 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  42.8 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.25 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  31.73 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.73 
 
 		 411 aa  85.9  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 1019 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 1052 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.41 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.83 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  27.34 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.42 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  28.88 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.24 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  27.68 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.71 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  24.34 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.52 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.37 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 		 1016 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  27.62 
 
 		 781 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.34 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.59 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  27.34 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  24.44 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  25.84 
 
 		 543 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.29 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.96 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  21.97 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 1048 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.57 
 
 		 803 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  28.03 
 
 		 379 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  26.6 
 
 		 781 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  25.84 
 
 		 786 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.57 
 
 		 783 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 1038 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  26.16 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.32 
 
 		 788 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  24.32 
 
 		 788 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  33.13 
 
 		 988 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  34.42 
 
 		 913 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  24.19 
 
 		 788 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 1187 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  29.31 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.73 
 
 		 1049 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.93 
 
 		 958 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 915 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.62 
 
 		 1066 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1151 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 1040 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1094 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  27.78 
 
 		 997 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  27.68 
 
 		 951 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  26.37 
 
 		 920 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  26.09 
 
 		 986 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  27.78 
 
 		 997 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  39.73 
 
 		 991 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  36.62 
 
 		 993 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 1038 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  44.9 
 
 		 1135 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.04 
 
 		 1048 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.74 
 
 		 1185 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  29.71 
 
 		 1043 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  28.49 
 
 		 780 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>