More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3055 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  84.49 
 
 		 492 aa  751    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  86.84 
 
 		 490 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  84.49 
 
 		 492 aa  751    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  100 
 
 		 494 aa  971    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  84.49 
 
 		 492 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  67.43 
 
 		 491 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  66.19 
 
 		 482 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  62.05 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  59.3 
 
 		 474 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  54.71 
 
 		 487 aa  475  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  54.21 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  54.57 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  54.9 
 
 		 493 aa  445  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  54.18 
 
 		 544 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  50.22 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  51.48 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  52.71 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  51.83 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  51.42 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  54.15 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  49.59 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  49.56 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  54.13 
 
 		 479 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  47.39 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  54.41 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  49.34 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  49.79 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  48.48 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  52.52 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  49.67 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  51.69 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  53.85 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  38.37 
 
 		 491 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  38.16 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  38.16 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  38.16 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  38.16 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  38.16 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  38.16 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  38.23 
 
 		 491 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  39.04 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.83 
 
 		 485 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.4 
 
 		 448 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  37.34 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  37.39 
 
 		 442 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.34 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.66 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  32.55 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.37 
 
 		 438 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  37.09 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.52 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.4 
 
 		 475 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  38.06 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.84 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  38.38 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.76 
 
 		 466 aa  259  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.46 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.48 
 
 		 475 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.65 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  34.72 
 
 		 497 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.98 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.63 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.18 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  35.18 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.68 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.46 
 
 		 484 aa  239  8e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  34.12 
 
 		 524 aa  239  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.48 
 
 		 458 aa  239  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.66 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  35.5 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  33.78 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  36.46 
 
 		 430 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.91 
 
 		 450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.7 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  35.04 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.04 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.11 
 
 		 476 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  35.79 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.79 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  32.91 
 
 		 516 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.83 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  29.98 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.9 
 
 		 507 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.39 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.89 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.47 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  31.05 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.74 
 
 		 464 aa  220  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.82 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.82 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.82 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.82 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.82 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.89 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>