More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2888 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  86.59 
 
 
164 aa  295  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  77.02 
 
 
165 aa  256  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  77.02 
 
 
165 aa  256  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  77.02 
 
 
165 aa  256  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  72.78 
 
 
163 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  57.24 
 
 
155 aa  175  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
157 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 
152 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 
164 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  46.05 
 
 
166 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 
159 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.77 
 
 
453 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  40.11 
 
 
182 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  43.42 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  40.96 
 
 
178 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 
186 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
187 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
154 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
154 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
152 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 
196 aa  104  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 
154 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 
174 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
154 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  37.97 
 
 
160 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  38.01 
 
 
188 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
160 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
160 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  40.38 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  41.82 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  36.97 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
183 aa  94.4  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.8 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 
158 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
182 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  37.11 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  30.82 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  36.59 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.37 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  37.11 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 
175 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.07 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  33.74 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.82 
 
 
164 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.36 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  32.69 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  37.75 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.75 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  36.63 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  35.67 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  39.24 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  32.45 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  32.45 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>