42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2884 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  72.99 
 
 
199 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  63.33 
 
 
212 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  63.33 
 
 
212 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  65.35 
 
 
222 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  50.72 
 
 
214 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  51.01 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  41 
 
 
220 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  48.3 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  41.27 
 
 
187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  40.8 
 
 
189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  42.86 
 
 
208 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  40.72 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  40.93 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  45.61 
 
 
208 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  41.62 
 
 
204 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  39.2 
 
 
197 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  43.53 
 
 
213 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  38.46 
 
 
206 aa  121  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  39.18 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  37.63 
 
 
205 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  40 
 
 
211 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  39.69 
 
 
201 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  36.14 
 
 
211 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  35.32 
 
 
200 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  40.94 
 
 
211 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  38.12 
 
 
179 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  41.86 
 
 
192 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  39.68 
 
 
201 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  36.22 
 
 
197 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  39.88 
 
 
201 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  37.74 
 
 
231 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  37.26 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  35.14 
 
 
179 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  35.33 
 
 
204 aa  92  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  35.93 
 
 
172 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  30.12 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  38.79 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  30.58 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  26.82 
 
 
363 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  28.65 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  31.08 
 
 
412 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>