86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2826 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
646 aa  1240    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  88.94 
 
 
642 aa  1098    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  88.63 
 
 
641 aa  1061    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  87.09 
 
 
637 aa  1033    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  88.63 
 
 
641 aa  1061    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  59.42 
 
 
665 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  59.58 
 
 
665 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  59.42 
 
 
665 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  56.69 
 
 
676 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  57.17 
 
 
672 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  42.65 
 
 
651 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  43.95 
 
 
675 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  44.44 
 
 
687 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.53 
 
 
686 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  37.38 
 
 
678 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  36.75 
 
 
692 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  34.8 
 
 
681 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  35.26 
 
 
664 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.32 
 
 
731 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  35.67 
 
 
691 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  35.14 
 
 
718 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  35.45 
 
 
651 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  37.56 
 
 
632 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  36.01 
 
 
718 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  34.02 
 
 
679 aa  256  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  35.98 
 
 
739 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  34.63 
 
 
708 aa  238  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  33.23 
 
 
736 aa  237  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  37.31 
 
 
671 aa  231  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  31.57 
 
 
687 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  31.39 
 
 
722 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  32.02 
 
 
752 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  31.87 
 
 
697 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  32.84 
 
 
631 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  34.14 
 
 
719 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  31.18 
 
 
708 aa  210  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  39.12 
 
 
661 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.91 
 
 
683 aa  201  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.86 
 
 
613 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  32.7 
 
 
711 aa  190  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  36.64 
 
 
651 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.31 
 
 
654 aa  171  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  28.71 
 
 
671 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.5 
 
 
653 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  37.55 
 
 
319 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.88 
 
 
319 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  31.49 
 
 
310 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  31.16 
 
 
322 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  32.56 
 
 
328 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  30.89 
 
 
308 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  30.42 
 
 
331 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  30.42 
 
 
331 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  30.53 
 
 
326 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  30.53 
 
 
331 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.69 
 
 
604 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.95 
 
 
394 aa  77  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  29.78 
 
 
354 aa  77  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  29.73 
 
 
254 aa  73.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  29.63 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  32.58 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.56 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.03 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.23 
 
 
343 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.98 
 
 
327 aa  61.6  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  31.79 
 
 
343 aa  61.6  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  24.72 
 
 
274 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  24.34 
 
 
265 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  30.74 
 
 
339 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  24.01 
 
 
265 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  24.72 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  32.81 
 
 
387 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  26.89 
 
 
300 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  24.64 
 
 
264 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  23.03 
 
 
277 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  23.03 
 
 
277 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  26.87 
 
 
290 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  30.68 
 
 
559 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  23.6 
 
 
277 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  25.76 
 
 
290 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  25.76 
 
 
290 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30 
 
 
544 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.19 
 
 
246 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.91 
 
 
544 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.91 
 
 
544 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.09 
 
 
549 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>