More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2728 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  84.75 
 
 		 403 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  84.5 
 
 		 403 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  84.75 
 
 		 403 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  81.63 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  65.08 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  63.86 
 
 		 440 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  57.92 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  51.83 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 		 407 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  55.73 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  54.38 
 
 		 412 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  56.09 
 
 		 565 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  54.73 
 
 		 568 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  54.17 
 
 		 402 aa  329  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  56.95 
 
 		 408 aa  325  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  48.01 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  55.35 
 
 		 407 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  49.39 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  51.87 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  38.2 
 
 		 387 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  38.2 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  38.2 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  38.38 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  38.38 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  37.92 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.03 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.8 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.93 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.34 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.34 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.59 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.35 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.25 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.13 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.35 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.35 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  24.31 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  24.31 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.05 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 484 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  32.27 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 		 485 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  31.84 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.69 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.18 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.4 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  24.59 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  29.55 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  28.24 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  23.76 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  23.8 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.91 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  24.27 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.93 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 516 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0922  inner membrane transport protein YdhC  24.07 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.18 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>