129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2688 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  89.16 
 
 
286 aa  507  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  68.42 
 
 
286 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  66.67 
 
 
285 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  49.13 
 
 
291 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.7 
 
 
283 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  47.4 
 
 
285 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  49.44 
 
 
290 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  46.48 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  47.1 
 
 
334 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  45.99 
 
 
304 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.41 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  48.22 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  41.32 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  43.01 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  42.01 
 
 
324 aa  212  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  45.73 
 
 
303 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  48.36 
 
 
276 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  48.36 
 
 
276 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  48.36 
 
 
276 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  47.35 
 
 
285 aa  208  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  45.25 
 
 
294 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  44.91 
 
 
287 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  45.56 
 
 
285 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  43.61 
 
 
283 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  43.61 
 
 
283 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  43.61 
 
 
283 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.65 
 
 
272 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  43.1 
 
 
296 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  45.59 
 
 
281 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  42.16 
 
 
303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  42.16 
 
 
303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  42.16 
 
 
303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  44.02 
 
 
301 aa  191  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  42.38 
 
 
279 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  40.47 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  39.93 
 
 
288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  34.15 
 
 
275 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  32.84 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  35.52 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.32 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.33 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.82 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  24.67 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  25.67 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  25.26 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.03 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.04 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  30.48 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  30.48 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  25.34 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  25.74 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  30.48 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  26.67 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  26.4 
 
 
346 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.98 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  25.74 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  25.37 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  25.37 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  25.37 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.48 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  27.95 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  24.26 
 
 
318 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.44 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.19 
 
 
350 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  25.61 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.81 
 
 
336 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  23.61 
 
 
360 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  24.08 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  27.55 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  27.32 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  27.55 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  27.49 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.46 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.54 
 
 
352 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  22.87 
 
 
345 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  23.8 
 
 
349 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  27.17 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.1 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  29.46 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  25.71 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  24.91 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  23.8 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  23.8 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  28.92 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  26.83 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  23.62 
 
 
349 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.95 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  26.48 
 
 
347 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  27.45 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  21.85 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.48 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  25.9 
 
 
304 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>