More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2483 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  93.96 
 
 
548 aa  1038    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1127    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  82.17 
 
 
550 aa  910    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  60.18 
 
 
541 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  82.17 
 
 
550 aa  908    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  82.17 
 
 
550 aa  910    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  49.75 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  47.43 
 
 
395 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  50 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  49.33 
 
 
393 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  43.59 
 
 
396 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  44.84 
 
 
394 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  46.61 
 
 
389 aa  300  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  44.2 
 
 
396 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  40.64 
 
 
385 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.04 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  36.63 
 
 
390 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  35.5 
 
 
390 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.75 
 
 
381 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.67 
 
 
378 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.45 
 
 
394 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.48 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.71 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.32 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.37 
 
 
390 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.02 
 
 
388 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  37.66 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  36.9 
 
 
385 aa  190  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.71 
 
 
386 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  35.15 
 
 
402 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  38.17 
 
 
383 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  36.39 
 
 
385 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  35.28 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  38.76 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  34.24 
 
 
385 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.78 
 
 
391 aa  183  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.03 
 
 
389 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.92 
 
 
388 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.03 
 
 
385 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.92 
 
 
388 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.86 
 
 
390 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  36.96 
 
 
395 aa  179  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.59 
 
 
392 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  35.35 
 
 
385 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.82 
 
 
383 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  35.35 
 
 
385 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  38.14 
 
 
402 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.21 
 
 
388 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.21 
 
 
388 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.89 
 
 
402 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.42 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.69 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  35.93 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  37.18 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.45 
 
 
383 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  34.29 
 
 
390 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  32.65 
 
 
388 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.55 
 
 
383 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.29 
 
 
397 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  36.29 
 
 
382 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  35.88 
 
 
393 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.44 
 
 
388 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  33.24 
 
 
400 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.16 
 
 
384 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.56 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  34.03 
 
 
389 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.24 
 
 
383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 
389 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.9 
 
 
384 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.86 
 
 
381 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34.9 
 
 
381 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  32.24 
 
 
381 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.81 
 
 
389 aa  159  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  35.7 
 
 
389 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  35.29 
 
 
389 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.96 
 
 
382 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.02 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.52 
 
 
379 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.91 
 
 
386 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  32.53 
 
 
394 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  32.89 
 
 
384 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.55 
 
 
360 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  30.11 
 
 
391 aa  140  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  51.56 
 
 
132 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.82 
 
 
389 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.97 
 
 
379 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 
388 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  29.21 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  49.61 
 
 
135 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.25 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.9 
 
 
388 aa  134  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.55 
 
 
389 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  39.92 
 
 
384 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  29.98 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  32.19 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.48 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>