More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2466 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  100 
 
 
424 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  92.44 
 
 
417 aa  732    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  80.05 
 
 
414 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  80.84 
 
 
429 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  92.44 
 
 
417 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  83.71 
 
 
402 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  92.44 
 
 
417 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  92.48 
 
 
421 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  73.59 
 
 
419 aa  591  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  59.22 
 
 
411 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  59.46 
 
 
412 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  59.95 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  58.48 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  58.48 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  58.48 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  54.95 
 
 
403 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  54.46 
 
 
404 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  42.51 
 
 
426 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  43.24 
 
 
405 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.86 
 
 
430 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  40.62 
 
 
441 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  41.01 
 
 
431 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  42.27 
 
 
444 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  40.53 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  39.81 
 
 
430 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  40.1 
 
 
440 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  37.59 
 
 
431 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  38.22 
 
 
426 aa  239  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  37.77 
 
 
426 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  38.65 
 
 
438 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  36.96 
 
 
423 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  38.52 
 
 
459 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  38.17 
 
 
433 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  38.21 
 
 
455 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  36.91 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.5 
 
 
421 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  40.71 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  36.67 
 
 
433 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  37.68 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  38.74 
 
 
426 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  37.84 
 
 
433 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.68 
 
 
437 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  36.65 
 
 
432 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.39 
 
 
434 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.94 
 
 
421 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.5 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  36.98 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  37.14 
 
 
423 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.75 
 
 
407 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  36.57 
 
 
423 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  34.99 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  33.25 
 
 
431 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  34.5 
 
 
470 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.16 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.41 
 
 
411 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  37.38 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.75 
 
 
480 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.17 
 
 
425 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.8 
 
 
419 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  31.41 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.41 
 
 
413 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.84 
 
 
420 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.39 
 
 
413 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  33.33 
 
 
419 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.44 
 
 
417 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.94 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  30.4 
 
 
432 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.01 
 
 
432 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.77 
 
 
436 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.91 
 
 
409 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.56 
 
 
401 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  36.29 
 
 
409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  34.47 
 
 
415 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  36.29 
 
 
409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  36.29 
 
 
409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  31.25 
 
 
440 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.01 
 
 
407 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.27 
 
 
412 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  32.71 
 
 
413 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.41 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  31.41 
 
 
478 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.79 
 
 
461 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  31.4 
 
 
482 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  34.12 
 
 
391 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.5 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.31 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  33.25 
 
 
396 aa  154  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  32.17 
 
 
434 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  30.9 
 
 
408 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.79 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  27.91 
 
 
412 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.63 
 
 
461 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  27.44 
 
 
412 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  33.33 
 
 
414 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  32.89 
 
 
409 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.87 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 
445 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  33.25 
 
 
413 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  32.69 
 
 
445 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.74 
 
 
447 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>