158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2416 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  92.7 
 
 
236 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  77.68 
 
 
235 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  77.68 
 
 
235 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  77.68 
 
 
235 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  68.54 
 
 
216 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  58.6 
 
 
216 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  58.14 
 
 
227 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  55.87 
 
 
224 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  54.63 
 
 
218 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  57.49 
 
 
236 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  54.21 
 
 
230 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 
227 aa  174  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  39.53 
 
 
208 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
234 aa  83.2  4e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
249 aa  80.9  2e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
270 aa  75.5  8e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  33.13 
 
 
248 aa  74.3  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
247 aa  73.6  3e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
227 aa  70.5  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
250 aa  68.6  9e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 
226 aa  68.6  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
221 aa  66.2  5e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
229 aa  63.5  3e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
255 aa  62  8e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
207 aa  62  9e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
255 aa  60.1  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  33.09 
 
 
288 aa  58.2  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 
209 aa  57.4  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  3.22137e-05 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  57.4  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
272 aa  57.4  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 
224 aa  57  3e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
211 aa  56.6  3e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
211 aa  56.6  3e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  37.74 
 
 
234 aa  57  3e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
273 aa  56.6  4e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
234 aa  55.5  8e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
213 aa  55.1  1e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
318 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
318 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
316 aa  54.3  2e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
316 aa  54.3  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
318 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
240 aa  53.9  2e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
276 aa  54.3  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
317 aa  53.9  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
316 aa  54.3  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
221 aa  54.3  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  41.18 
 
 
259 aa  54.3  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
318 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
272 aa  53.9  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
222 aa  53.1  4e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  53.1  4e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
239 aa  52.8  5e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.91 
 
 
191 aa  52.4  6e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.29 
 
 
210 aa  52.4  7e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.29 
 
 
210 aa  52.4  7e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
223 aa  52  8e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
235 aa  51.6  1e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  52  1e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
235 aa  51.6  1e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
235 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
224 aa  51.2  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
238 aa  51.2  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  36.96 
 
 
214 aa  51.6  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 
242 aa  51.6  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
212 aa  51.6  1e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
235 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
290 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  32.63 
 
 
213 aa  51.6  1e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
235 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
212 aa  51.6  1e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
212 aa  51.6  1e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
242 aa  51.2  1e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  33.68 
 
 
227 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
222 aa  51.6  1e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
212 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 
220 aa  50.8  2e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 
263 aa  50.8  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  46.67 
 
 
233 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
235 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  55.1 
 
 
221 aa  50.8  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
335 aa  50.4  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  46.67 
 
 
233 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
227 aa  49.7  4e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
295 aa  49.7  4e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
228 aa  49.3  6e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  45 
 
 
238 aa  48.9  7e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  43.66 
 
 
205 aa  48.9  7e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.52 
 
 
227 aa  48.9  7e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  45 
 
 
238 aa  48.9  8e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 
214 aa  48.5  9e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  9.3152e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
245 aa  48.5  9e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>