More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2413 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  93.95 
 
 
429 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  100 
 
 
494 aa  1009    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  93.95 
 
 
429 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  52.21 
 
 
498 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  55.21 
 
 
486 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  53.05 
 
 
495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  51.62 
 
 
495 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  51.95 
 
 
495 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  52.54 
 
 
499 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  45.03 
 
 
480 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  42.26 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  42.2 
 
 
484 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  41.16 
 
 
484 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  42.2 
 
 
514 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  40.11 
 
 
537 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  43.14 
 
 
489 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  43.09 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  39.43 
 
 
539 aa  339  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.46 
 
 
533 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  39.33 
 
 
530 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  40 
 
 
479 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  42.05 
 
 
477 aa  323  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  42.94 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  41.94 
 
 
486 aa  309  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.74 
 
 
530 aa  306  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.97 
 
 
529 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  38.67 
 
 
529 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  37.64 
 
 
529 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  37.45 
 
 
529 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  37.64 
 
 
529 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  32.7 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  29.86 
 
 
484 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  29.74 
 
 
494 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  32.3 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  30.24 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  30.33 
 
 
503 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  31.75 
 
 
493 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 
486 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  30.81 
 
 
484 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  30.81 
 
 
484 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  28.91 
 
 
484 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  29.48 
 
 
506 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  27.49 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.61 
 
 
703 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  31.33 
 
 
489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  31.38 
 
 
513 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.62 
 
 
484 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.32 
 
 
484 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 
493 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  28.8 
 
 
524 aa  150  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  27.77 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  27.74 
 
 
488 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.88 
 
 
548 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  30.38 
 
 
519 aa  146  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 
571 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 
488 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  27.47 
 
 
517 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  28.9 
 
 
549 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  29.38 
 
 
540 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  27.15 
 
 
499 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 
500 aa  143  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  28.97 
 
 
500 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  27.67 
 
 
545 aa  143  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  28.82 
 
 
527 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  31.42 
 
 
553 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 
499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  31.08 
 
 
553 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  29.98 
 
 
505 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  26.16 
 
 
489 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  31.16 
 
 
775 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  30.37 
 
 
710 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  29.87 
 
 
484 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  27.51 
 
 
508 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  29.76 
 
 
513 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.68 
 
 
489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 
489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 
544 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 
544 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 
490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  30.52 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  32.25 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  28.95 
 
 
493 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  32.16 
 
 
824 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  31.19 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  30.05 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  30.05 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  32.21 
 
 
489 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.31 
 
 
873 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  29.23 
 
 
489 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  31.23 
 
 
554 aa  134  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  29.43 
 
 
481 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.54 
 
 
505 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.3 
 
 
504 aa  134  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  28.46 
 
 
489 aa  133  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 
808 aa  133  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  31.61 
 
 
816 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  29.7 
 
 
834 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>