156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2378 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  90.51 
 
 
140 aa  259  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  84.44 
 
 
138 aa  238  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  84.44 
 
 
138 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  84.44 
 
 
138 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  41.61 
 
 
311 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  35.65 
 
 
143 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  38.52 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  43.1 
 
 
121 aa  79.7  1e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.5 
 
 
143 aa  78.6  3e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  34.11 
 
 
148 aa  77.8  4e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32.46 
 
 
136 aa  77  8e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.61 
 
 
131 aa  77  9e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  73.9  6e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  37.04 
 
 
317 aa  73.2  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.22 
 
 
137 aa  73.2  1e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.72 
 
 
141 aa  73.2  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  43.75 
 
 
119 aa  73.2  1e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  35.87 
 
 
145 aa  72  2e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31.3 
 
 
130 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  36.89 
 
 
146 aa  72  3e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.23 
 
 
130 aa  71.2  4e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  71.2  4e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  70.9  5e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  70.9  5e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  34.75 
 
 
333 aa  70.5  7e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  70.1  9e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.06 
 
 
321 aa  70.1  9e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  26.81 
 
 
146 aa  70.1  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  29.71 
 
 
139 aa  69.7  1e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  36.04 
 
 
146 aa  70.1  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.46 
 
 
133 aa  68.9  2e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.95 
 
 
130 aa  69.3  2e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  34.07 
 
 
318 aa  68.6  3e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  32.23 
 
 
140 aa  68.6  3e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  34.07 
 
 
318 aa  68.6  3e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.38 
 
 
149 aa  67.8  4e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  33.6 
 
 
135 aa  67.8  5e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  34.07 
 
 
317 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  37.07 
 
 
128 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  5.82925e-06 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  34.86 
 
 
132 aa  67.4  7e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  67.4  7e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.07 
 
 
130 aa  67  9e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  42.53 
 
 
127 aa  65.5  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.09 
 
 
138 aa  65.5  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.06 
 
 
132 aa  65.5  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  65.1  3e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  35.04 
 
 
136 aa  65.5  3e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  35.16 
 
 
144 aa  65.1  3e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  63.9  6e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.61 
 
 
137 aa  63.2  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  27.82 
 
 
137 aa  62.8  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  40.4 
 
 
123 aa  63.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.8 
 
 
319 aa  62.8  1e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33.6 
 
 
143 aa  63.2  1e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  62.8  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  32.06 
 
 
324 aa  62.4  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.99 
 
 
137 aa  61.6  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  36.28 
 
 
132 aa  61.6  3e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  30.36 
 
 
132 aa  61.2  4e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.04 
 
 
127 aa  61.6  4e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.04 
 
 
127 aa  61.2  4e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  35.48 
 
 
129 aa  61.6  4e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.52 
 
 
135 aa  60.8  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  31.36 
 
 
175 aa  60.8  6e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  60.8  6e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  34.82 
 
 
152 aa  60.5  8e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.45 
 
 
137 aa  59.7  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  31.53 
 
 
120 aa  60.1  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  60.1  1e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.46 
 
 
131 aa  59.3  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  26.28 
 
 
141 aa  58.5  3e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.46433e-07  hitchhiker  6.44081e-06 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.82 
 
 
139 aa  58.2  4e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  29.46 
 
 
132 aa  57.8  5e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  33.96 
 
 
130 aa  57.8  5e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  36.08 
 
 
123 aa  57  8e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  33.94 
 
 
130 aa  57  8e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  40.4 
 
 
134 aa  57  9e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  33.07 
 
 
311 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  30.95 
 
 
132 aa  56.6  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  31.37 
 
 
140 aa  56.6  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  29.93 
 
 
136 aa  55.8  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  33.08 
 
 
322 aa  54.7  4e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 
132 aa  54.7  4e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  28.69 
 
 
140 aa  54.7  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  32.14 
 
 
125 aa  54.3  6e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.84 
 
 
134 aa  54.3  6e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  2.62786e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>