More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2230 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.78 
 
 
457 aa  800    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  78.22 
 
 
455 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
453 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.78 
 
 
457 aa  800    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.78 
 
 
457 aa  800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.17 
 
 
453 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  68.22 
 
 
455 aa  628  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.13 
 
 
453 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  52.31 
 
 
455 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  53.83 
 
 
482 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  48.8 
 
 
461 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  52.05 
 
 
455 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.8 
 
 
458 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.04 
 
 
464 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.28 
 
 
464 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  46.71 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  47.11 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  45.33 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  47.17 
 
 
453 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  45.56 
 
 
462 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.3 
 
 
470 aa  342  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.3 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.3 
 
 
470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.71 
 
 
496 aa  335  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.06 
 
 
451 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  44.82 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  45.06 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.82 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.06 
 
 
470 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.82 
 
 
470 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  44.58 
 
 
470 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  44.58 
 
 
470 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.06 
 
 
470 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  45.68 
 
 
441 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.64 
 
 
499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.44 
 
 
472 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.39 
 
 
442 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.82 
 
 
466 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.84 
 
 
460 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  38.99 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.96 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.64 
 
 
449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.58 
 
 
459 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
462 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 
464 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.12 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  41.5 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  40.27 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.23 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  41.72 
 
 
499 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  41.35 
 
 
499 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 
456 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  40.1 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.96 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.74 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  41.06 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.81 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.81 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.81 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  44.42 
 
 
506 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  40.84 
 
 
499 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 
503 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 
498 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.91 
 
 
461 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  41.5 
 
 
499 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  42.24 
 
 
499 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  42.96 
 
 
499 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 
457 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.87 
 
 
499 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.98 
 
 
459 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  41.87 
 
 
499 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.23 
 
 
456 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  41.87 
 
 
496 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  39.91 
 
 
499 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  41.28 
 
 
499 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  41.87 
 
 
496 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  41.87 
 
 
496 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  41.29 
 
 
499 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.58 
 
 
469 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  38.81 
 
 
462 aa  296  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  41.63 
 
 
499 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  41.63 
 
 
499 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.36 
 
 
462 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 
464 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.85 
 
 
459 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  39.74 
 
 
499 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.86 
 
 
459 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  40.4 
 
 
499 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  38.71 
 
 
489 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.48 
 
 
495 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.48 
 
 
495 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.91 
 
 
483 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  45.21 
 
 
447 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.09 
 
 
459 aa  289  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  44.4 
 
 
451 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 
475 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  38.8 
 
 
466 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  45.43 
 
 
489 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 
461 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>