More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2221 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.04 
 
 
646 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.04 
 
 
646 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.04 
 
 
627 aa  814    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.7 
 
 
646 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
609 aa  1197    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  61.27 
 
 
579 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.44 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.13 
 
 
505 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.26 
 
 
511 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.24 
 
 
509 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.54 
 
 
493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.5 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.07 
 
 
521 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.65 
 
 
494 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.44 
 
 
534 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.23 
 
 
540 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.42 
 
 
546 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 
790 aa  293  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 
579 aa  247  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
528 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 
488 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 
579 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 
489 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
529 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.43 
 
 
489 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 
510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
480 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.31 
 
 
522 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 
530 aa  210  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 
564 aa  210  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 
583 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 
524 aa  208  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  36.82 
 
 
467 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 
478 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 
522 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 
534 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.48 
 
 
530 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.49 
 
 
498 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
520 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 
534 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
503 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  33.66 
 
 
480 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 
504 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
477 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.03 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
463 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 
520 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.77 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  32.29 
 
 
493 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 
515 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
508 aa  197  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.07 
 
 
626 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
487 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 
532 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 
522 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 
472 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  34.25 
 
 
555 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 
487 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 
480 aa  193  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
485 aa  193  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 
545 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 
529 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.68 
 
 
502 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 
537 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 
521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.03 
 
 
541 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.77 
 
 
463 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.98 
 
 
481 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 
526 aa  190  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.73 
 
 
541 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 
529 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.92 
 
 
457 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 
520 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 
517 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 
529 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  34.34 
 
 
469 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.55 
 
 
476 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  33.73 
 
 
484 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 
525 aa  187  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 
551 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
763 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 
521 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
520 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 
522 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.31 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.31 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 
487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 
531 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.49 
 
 
514 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
527 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 
530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>