More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2184 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  91.3 
 
 
185 aa  341  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  78.57 
 
 
188 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  78.57 
 
 
188 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  78.57 
 
 
188 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  70.06 
 
 
187 aa  251  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  60.34 
 
 
187 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  59.54 
 
 
182 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  57.63 
 
 
180 aa  189  3e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  57.5 
 
 
201 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  50.29 
 
 
186 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  47.19 
 
 
194 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  50 
 
 
200 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  51.88 
 
 
191 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  57.14 
 
 
198 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  53.22 
 
 
181 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  54.39 
 
 
198 aa  152  3e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  50.29 
 
 
181 aa  151  6e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  45.98 
 
 
197 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  48.57 
 
 
196 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  46.29 
 
 
194 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  45.86 
 
 
195 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  50 
 
 
440 aa  148  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  48.59 
 
 
197 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  54.66 
 
 
197 aa  148  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  48.59 
 
 
197 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  45.71 
 
 
194 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  51.76 
 
 
195 aa  147  1e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  46.67 
 
 
194 aa  147  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  46.99 
 
 
194 aa  144  8e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  48.84 
 
 
203 aa  144  8e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.99 
 
 
196 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  49.12 
 
 
191 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  46.52 
 
 
207 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  46.78 
 
 
197 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  44.12 
 
 
199 aa  140  1e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  49.13 
 
 
197 aa  139  2e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  50 
 
 
216 aa  140  2e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  42.2 
 
 
186 aa  140  2e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  5.44297e-07 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  40.94 
 
 
198 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  44.71 
 
 
211 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  40.22 
 
 
196 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  41.62 
 
 
200 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.1397e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  42.78 
 
 
195 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  46.63 
 
 
193 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  41.67 
 
 
188 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  45.06 
 
 
193 aa  135  3e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  43.53 
 
 
199 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  42.35 
 
 
200 aa  134  6e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  43.93 
 
 
195 aa  134  7e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  45.61 
 
 
204 aa  134  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  45.39 
 
 
201 aa  134  1e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  44.26 
 
 
195 aa  133  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26766e-07 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  44.12 
 
 
210 aa  133  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  43.35 
 
 
184 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  43.35 
 
 
184 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  46.01 
 
 
193 aa  132  2e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  46.01 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  46.01 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  46.01 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  48.37 
 
 
195 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  49.67 
 
 
195 aa  132  4e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  49.67 
 
 
195 aa  132  4e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.83425e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  48.37 
 
 
195 aa  132  4e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  44.13 
 
 
192 aa  131  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  43.53 
 
 
200 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  44.12 
 
 
193 aa  131  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  45.4 
 
 
194 aa  131  7e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  45.4 
 
 
194 aa  130  8e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  45.66 
 
 
180 aa  130  1e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  43.75 
 
 
180 aa  130  1e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  41.67 
 
 
184 aa  130  2e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  45.81 
 
 
200 aa  129  2e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  45 
 
 
195 aa  129  2e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  41.07 
 
 
178 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  41.82 
 
 
193 aa  128  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  41.04 
 
 
201 aa  128  5e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  44.31 
 
 
185 aa  128  5e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  40.91 
 
 
179 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  43.29 
 
 
193 aa  127  9e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  43.37 
 
 
194 aa  127  1e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  41.38 
 
 
193 aa  127  1e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  40.78 
 
 
200 aa  126  1e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  48.68 
 
 
180 aa  127  1e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  43.41 
 
 
197 aa  125  2e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  38.6 
 
 
196 aa  126  2e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  41.76 
 
 
190 aa  126  2e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  41.11 
 
 
194 aa  125  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  42.94 
 
 
195 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  40.78 
 
 
200 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  39.23 
 
 
204 aa  125  4e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  42.37 
 
 
198 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.56 
 
 
193 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  41.14 
 
 
195 aa  124  8e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  46.47 
 
 
193 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  40.44 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  41.48 
 
 
182 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  44.17 
 
 
197 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  40.88 
 
 
194 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>