More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2148 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2148  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  248  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00363321  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4555  resolvase domain-containing protein  81.75 
 
 
129 aa  195  2e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191563  normal  0.331166 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  57.5 
 
 
213 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5591  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 
180 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3261  resolvase domain-containing protein  54.17 
 
 
194 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154119  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  46.72 
 
 
190 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.06 
 
 
197 aa  82.4  2e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  38.53 
 
 
213 aa  79  2e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  40.52 
 
 
195 aa  77.8  5e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  41.03 
 
 
228 aa  77.8  5e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.9 
 
 
197 aa  77.4  6e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.4315e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  35.9 
 
 
196 aa  77  8e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  36.84 
 
 
196 aa  77  8e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
206 aa  76.6  1e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  37.72 
 
 
196 aa  76.6  1e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.79 
 
 
185 aa  75.9  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  41.75 
 
 
191 aa  75.9  2e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  33.9 
 
 
184 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
185 aa  74.7  4e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
219 aa  74.3  5e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
219 aa  74.3  5e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
219 aa  74.3  5e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  33.05 
 
 
184 aa  73.9  6e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
197 aa  73.9  7e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  37.82 
 
 
231 aa  73.6  8e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.61 
 
 
185 aa  73.6  9e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
191 aa  73.6  9e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  38.81 
 
 
193 aa  73.2  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.52 
 
 
185 aa  73.2  1e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  35.04 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.04 
 
 
198 aa  73.2  1e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 
189 aa  72.4  2e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.04 
 
 
188 aa  71.6  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  8.35062e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.04 
 
 
190 aa  71.6  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 
201 aa  72  3e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.04 
 
 
187 aa  71.6  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.31801e-20 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 
202 aa  72  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.38 
 
 
194 aa  70.9  5e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.38 
 
 
194 aa  70.9  5e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 
185 aa  70.5  7e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 
180 aa  70.5  7e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.17 
 
 
185 aa  70.5  8e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.5 
 
 
204 aa  69.7  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.75 
 
 
185 aa  70.1  1e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  35.09 
 
 
181 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  40.5 
 
 
204 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 
188 aa  69.7  1e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.77256e-05 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  34.55 
 
 
186 aa  69.3  2e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 
188 aa  69.3  2e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  38.06 
 
 
191 aa  69.3  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
208 aa  69.3  2e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  39.6 
 
 
197 aa  69.3  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  1.50315e-14 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
189 aa  69.3  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  40.16 
 
 
192 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  38.68 
 
 
193 aa  68.9  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
189 aa  69.3  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.83 
 
 
219 aa  68.9  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  39.6 
 
 
192 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.48 
 
 
188 aa  69.3  2e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  39.6 
 
 
197 aa  69.3  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  3.88244e-13 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  34.21 
 
 
185 aa  68.6  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  40 
 
 
191 aa  68.9  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  32.2 
 
 
201 aa  68.9  2e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.87 
 
 
218 aa  68.9  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  40.16 
 
 
192 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  39.6 
 
 
197 aa  69.3  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  1.47912e-10 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  38.46 
 
 
193 aa  68.6  3e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  35.59 
 
 
186 aa  68.2  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 
196 aa  68.6  3e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
197 aa  68.6  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  30 
 
 
192 aa  68.6  3e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
197 aa  68.6  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 
188 aa  68.2  4e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  37.69 
 
 
222 aa  68.2  4e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30 
 
 
184 aa  68.2  4e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.21 
 
 
184 aa  68.2  4e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.5 
 
 
190 aa  67.8  5e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  37.01 
 
 
133 aa  67.8  5e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.59 
 
 
184 aa  67.8  5e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.19 
 
 
204 aa  67.4  6e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.07 
 
 
193 aa  67.4  6e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.17 
 
 
183 aa  67.4  6e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.19 
 
 
204 aa  67.4  6e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.19 
 
 
204 aa  67.4  6e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.9 
 
 
185 aa  67.4  7e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.9 
 
 
185 aa  67.4  7e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
193 aa  67  8e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.34 
 
 
184 aa  67  8e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  37.9 
 
 
192 aa  66.6  1e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  32.5 
 
 
184 aa  66.2  1e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  35.34 
 
 
190 aa  66.6  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 
208 aa  66.2  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.79 
 
 
203 aa  66.6  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
193 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  35.59 
 
 
201 aa  66.6  1e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 
185 aa  66.2  1e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
193 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  37.9 
 
 
191 aa  66.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  37.89 
 
 
203 aa  65.9  2e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 
193 aa  65.9  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>