27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2147 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  90.16 
 
 
194 aa  350  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  79.33 
 
 
193 aa  294  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  79.33 
 
 
193 aa  294  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  79.33 
 
 
193 aa  294  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  71.98 
 
 
195 aa  278  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  64.77 
 
 
193 aa  230  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  62.86 
 
 
195 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  65.71 
 
 
197 aa  221  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  62.29 
 
 
194 aa  221  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  62.29 
 
 
194 aa  220  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  62.86 
 
 
190 aa  218  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  57.98 
 
 
203 aa  215  3e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  64.04 
 
 
195 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  54.55 
 
 
191 aa  211  6e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  56.82 
 
 
223 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  56.11 
 
 
193 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  56.57 
 
 
196 aa  201  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  59.78 
 
 
193 aa  200  1e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  54.35 
 
 
196 aa  196  1e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  54.3 
 
 
188 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  53.26 
 
 
204 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  49.44 
 
 
195 aa  182  4e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  43.18 
 
 
183 aa  133  2e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.83 
 
 
206 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  27.83 
 
 
206 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.31 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>