More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2117 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.77 
 
 
268 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  95.98 
 
 
249 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  95.98 
 
 
249 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.98 
 
 
249 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  79.15 
 
 
266 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.75 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
253 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
253 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 
257 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.61 
 
 
269 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  43.53 
 
 
261 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  43.53 
 
 
261 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  43.14 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  43.14 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  43.14 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
247 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  43.53 
 
 
261 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
247 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
247 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.22 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  42.64 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  42.75 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 
267 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
254 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  46.36 
 
 
254 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
260 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
254 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.97 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
256 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
266 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.8 
 
 
267 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.85 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
269 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
269 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
264 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
254 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
287 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 
258 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
257 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
257 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  38.37 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.21 
 
 
260 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
254 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11159  enoyl-CoA hydratase  72.32 
 
 
113 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0174396  normal  0.52608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
254 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
255 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
259 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
260 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  36.92 
 
 
260 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
273 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
259 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
263 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
259 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  43.31 
 
 
254 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
265 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  37.98 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
266 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
254 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
797 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  35.55 
 
 
260 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
261 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
259 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
263 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
259 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
259 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
263 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
267 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>