29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2045 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  59.87 
 
 
168 aa  183  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  45.06 
 
 
240 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  36.71 
 
 
272 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  38.54 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.54 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  46.48 
 
 
361 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  45.12 
 
 
357 aa  63.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  31.1 
 
 
365 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  43.75 
 
 
323 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  43.75 
 
 
323 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  43.75 
 
 
323 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  30.67 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  44.12 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  43.75 
 
 
322 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  27.66 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  33.33 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  29.79 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  30.77 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  34.74 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  31.13 
 
 
319 aa  47.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  37.18 
 
 
327 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  35.44 
 
 
327 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  31.88 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  26.37 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.25 
 
 
202 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  33.78 
 
 
185 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  33.98 
 
 
537 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  30.47 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>