154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2029 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2029  patatin  100 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  79.51 
 
 		 288 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  69.96 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  69.96 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  69.96 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  68.68 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  42.38 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  39.35 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  35.74 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  34.22 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  36.98 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  36.76 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  34.43 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  37.62 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  33.33 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.12 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  31.14 
 
 		 330 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  34.12 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  33.47 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  34.32 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  31.37 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  30.83 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  31.13 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  30.56 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  33.2 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  29.71 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  30.92 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  29.61 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  31 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  45.83 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.35 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.04 
 
 		 803 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.49 
 
 		 796 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.04 
 
 		 803 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.04 
 
 		 803 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.49 
 
 		 798 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  50 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.17 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  28.77 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  50 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.68 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  39 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  28.63 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.6 
 
 		 804 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  31.1 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  40.22 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  29.69 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  29.17 
 
 		 667 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  29.69 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.36 
 
 		 377 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  27.31 
 
 		 377 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  27.94 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  29.15 
 
 		 745 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.69 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  37.08 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  28.25 
 
 		 852 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  43.06 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.21 
 
 		 746 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.68 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.17 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  27.05 
 
 		 411 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  25 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  27.8 
 
 		 930 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.96 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  27.8 
 
 		 920 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  23.98 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.38 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.7 
 
 		 813 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 		 581 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  27.8 
 
 		 933 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  40.24 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  27.2 
 
 		 413 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  27.8 
 
 		 945 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  27.8 
 
 		 728 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  34.13 
 
 		 345 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  27.88 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.9 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  27.65 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30.41 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30 
 
 		 419 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  27.86 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.36 
 
 		 767 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.38 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.38 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  33.94 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.21 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  27.36 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.38 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26.13 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  40.62 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  26.36 
 
 		 707 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.38 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  41.67 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  28.71 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  27.35 
 
 		 421 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  28.16 
 
 		 790 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.02 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  27.03 
 
 		 714 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1632  Patatin  34.78 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>