78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2000 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  100 
 
 
385 aa  761  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  36.97 
 
 
413 aa  222  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  35.62 
 
 
427 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  35.34 
 
 
427 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  33.42 
 
 
417 aa  165  1e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  36.61 
 
 
427 aa  163  5e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  35.26 
 
 
376 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  33.59 
 
 
420 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  34.11 
 
 
346 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  33.24 
 
 
407 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  32.65 
 
 
417 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  33.16 
 
 
410 aa  137  3e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  33.16 
 
 
410 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  33.16 
 
 
410 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  31.27 
 
 
388 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  34.21 
 
 
426 aa  131  2e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  34.21 
 
 
377 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  34.21 
 
 
377 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  31.32 
 
 
379 aa  129  1e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  32.1 
 
 
366 aa  127  2e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  31.5 
 
 
375 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  30.65 
 
 
399 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  30.65 
 
 
399 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  30.52 
 
 
386 aa  122  1e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  28.77 
 
 
397 aa  121  2e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  30.36 
 
 
382 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  30.03 
 
 
376 aa  120  5e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  33.15 
 
 
400 aa  119  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  33.71 
 
 
444 aa  119  1e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  33.43 
 
 
383 aa  117  4e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  31.47 
 
 
397 aa  115  1e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  32.62 
 
 
442 aa  114  4e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  30.5 
 
 
406 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  29.36 
 
 
395 aa  112  1e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  29.71 
 
 
415 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  34.86 
 
 
451 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  29.6 
 
 
392 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  30.34 
 
 
405 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  27.32 
 
 
432 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  32.68 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  33.71 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  23.87 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
433 aa  84.7  2e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
433 aa  84.7  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
433 aa  84.7  3e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  25 
 
 
434 aa  83.2  8e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  29.48 
 
 
422 aa  76.6  7e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  34.51 
 
 
422 aa  68.6  2e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  29.73 
 
 
426 aa  66.6  7e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  33.1 
 
 
422 aa  65.5  2e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  26.67 
 
 
420 aa  65.1  2e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  34.78 
 
 
201 aa  61.2  3e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  25.48 
 
 
450 aa  57  6e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  30.05 
 
 
527 aa  53.5  6e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  22.63 
 
 
424 aa  52  2e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  25.79 
 
 
447 aa  51.6  3e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  25.79 
 
 
447 aa  51.6  3e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  25.79 
 
 
447 aa  51.6  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  31.41 
 
 
439 aa  51.2  3e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  26.51 
 
 
446 aa  51.6  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  25 
 
 
424 aa  50.4  5e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  25.73 
 
 
470 aa  50.1  7e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  26.01 
 
 
450 aa  49.7  9e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  25.4 
 
 
450 aa  49.7  9e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  31.15 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  25.14 
 
 
481 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  25.71 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
290 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  25.71 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  25.71 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  33.04 
 
 
465 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  28.07 
 
 
528 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  32.28 
 
 
527 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  42.03 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.34708e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  30.47 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0119  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.564453  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  28.37 
 
 
528 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>