More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1940 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.58 
 
 
288 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.2 
 
 
289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.2 
 
 
289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.2 
 
 
289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.25 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.68 
 
 
297 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.67 
 
 
298 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.11 
 
 
312 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.33 
 
 
312 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.66 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.34 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  47.93 
 
 
316 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
326 aa  225  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.72 
 
 
317 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 
305 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 
303 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
307 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  48 
 
 
302 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  46.86 
 
 
304 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  47.19 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  47.19 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.63 
 
 
329 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.3 
 
 
328 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  46.75 
 
 
303 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  44.63 
 
 
333 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
315 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  44.63 
 
 
329 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  46.53 
 
 
306 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  45.21 
 
 
305 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
312 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 
301 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
281 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 
300 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 
300 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 
300 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
310 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 
298 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 
319 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
290 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  45.21 
 
 
311 aa  198  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  44.08 
 
 
318 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 
299 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 
328 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
324 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
328 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
328 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
328 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
296 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
304 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
307 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  41.95 
 
 
302 aa  189  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 
317 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
314 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
312 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  43.42 
 
 
305 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  39.86 
 
 
308 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  39.51 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.12 
 
 
324 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
328 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  43.32 
 
 
309 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
303 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  36.36 
 
 
309 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  39.19 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  41.75 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
306 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  42.67 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  39.26 
 
 
301 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
308 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
303 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  36.45 
 
 
309 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 
306 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  43.95 
 
 
352 aa  168  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  40.8 
 
 
300 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  34.56 
 
 
309 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  34.56 
 
 
309 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.31 
 
 
303 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 
304 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  39.12 
 
 
319 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
309 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.75 
 
 
313 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 
308 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
313 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
320 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
325 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
325 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
326 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>