More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1938 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  88.48 
 
 
192 aa  346  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  77.08 
 
 
192 aa  314  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  77.08 
 
 
192 aa  314  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  77.08 
 
 
192 aa  314  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  73.3 
 
 
191 aa  277  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  62.63 
 
 
194 aa  221  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  59.14 
 
 
188 aa  220  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  56.68 
 
 
189 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 
201 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  56.68 
 
 
197 aa  205  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  55.98 
 
 
209 aa  204  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  58.82 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  55.08 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  53.85 
 
 
213 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  56.91 
 
 
199 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 
213 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  53.33 
 
 
217 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  56.61 
 
 
206 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  57.29 
 
 
195 aa  185  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  52.58 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  57.53 
 
 
191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  52.58 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  52.88 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  52.11 
 
 
202 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  54.01 
 
 
221 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  48.89 
 
 
185 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  49.24 
 
 
198 aa  160  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
188 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  48.72 
 
 
205 aa  159  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  49.72 
 
 
191 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
213 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
185 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
192 aa  154  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 
195 aa  154  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 
192 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 
192 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
187 aa  151  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
186 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
186 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
186 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
186 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 
192 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
187 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  49.19 
 
 
203 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.44 
 
 
214 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 
190 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  52.04 
 
 
202 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
205 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 
186 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  47.18 
 
 
202 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 
199 aa  148  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
210 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 
196 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  51.31 
 
 
204 aa  147  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 
217 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  38.14 
 
 
206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  47.74 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  35.52 
 
 
189 aa  145  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  46.78 
 
 
192 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
210 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
202 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 
185 aa  144  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
210 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4503  peptidyl-tRNA hydrolase  44.61 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
207 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
191 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
179 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.12 
 
 
193 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
204 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
206 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.6 
 
 
186 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 
197 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 
192 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
188 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 
203 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  39.31 
 
 
182 aa  141  7e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 
198 aa  140  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
183 aa  140  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>