268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1915 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
329 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  81.46 
 
 
332 aa  534  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  67.78 
 
 
332 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  67.48 
 
 
332 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  67.48 
 
 
332 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  61.09 
 
 
333 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  34.94 
 
 
894 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
901 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.22 
 
 
881 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.93 
 
 
909 aa  84.3  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  34.76 
 
 
926 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.91 
 
 
907 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
909 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
868 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  35.17 
 
 
821 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  32.09 
 
 
903 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
173 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  35.58 
 
 
902 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  34.64 
 
 
899 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  36.05 
 
 
892 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.33 
 
 
908 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  31.91 
 
 
950 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  36.5 
 
 
899 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  34.29 
 
 
887 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  32.93 
 
 
976 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
907 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1087  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
909 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  35.53 
 
 
902 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.64 
 
 
895 aa  69.3  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  33.57 
 
 
907 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.58 
 
 
934 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.65 
 
 
897 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
893 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  27.98 
 
 
911 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  29.28 
 
 
900 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
775 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  28.33 
 
 
893 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
872 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
812 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
175 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
926 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  27.98 
 
 
915 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.95 
 
 
831 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  27.95 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0861  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
173 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.84 
 
 
155 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
867 aa  63.5  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
227 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
887 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  30.07 
 
 
883 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
883 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  32.02 
 
 
897 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 
155 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  29.27 
 
 
894 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  37.29 
 
 
449 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
192 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
192 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.05 
 
 
911 aa  59.7  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  28.49 
 
 
877 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.12 
 
 
904 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
771 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
896 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.48 
 
 
636 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.09 
 
 
905 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
918 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0144  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
852 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1135  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
179 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370812  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  29.7 
 
 
887 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  27.37 
 
 
877 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
172 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  29.17 
 
 
901 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1106  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
179 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1123  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
179 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.645372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  32.12 
 
 
886 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
189 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
882 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
882 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  26.26 
 
 
880 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  26.26 
 
 
880 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
880 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  34.91 
 
 
167 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.52 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
889 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
926 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  31.88 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
898 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.5 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.47 
 
 
623 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  24.71 
 
 
194 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
229 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
206 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
897 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
175 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>