More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1722 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  72.72 
 
 		 885 aa  1243    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 934 aa  1861    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 513 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 		 489 aa  253  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  33.2 
 
 		 467 aa  243  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 		 486 aa  224  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  32.19 
 
 		 436 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  28.66 
 
 		 418 aa  181  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 442 aa  168  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  27.54 
 
 		 432 aa  163  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  28.6 
 
 		 431 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 431 aa  162  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  30.94 
 
 		 445 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  29.59 
 
 		 472 aa  150  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 399 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  27.36 
 
 		 417 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  29.41 
 
 		 453 aa  146  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  27.64 
 
 		 446 aa  145  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  27.95 
 
 		 450 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 443 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  29.49 
 
 		 453 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.59 
 
 		 452 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  26.55 
 
 		 474 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  27.9 
 
 		 448 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  30.58 
 
 		 436 aa  132  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  27.81 
 
 		 478 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  28.65 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  26.44 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  29.24 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  24.9 
 
 		 468 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.33 
 
 		 446 aa  129  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  23.71 
 
 		 427 aa  128  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  29.83 
 
 		 453 aa  129  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  29.92 
 
 		 455 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.62 
 
 		 447 aa  126  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  26.8 
 
 		 443 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  25.95 
 
 		 465 aa  126  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  27.97 
 
 		 472 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  27.94 
 
 		 491 aa  125  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  27.8 
 
 		 482 aa  125  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  27.85 
 
 		 444 aa  124  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  26.13 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 437 aa  124  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  28.09 
 
 		 488 aa  124  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  27.07 
 
 		 447 aa  124  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  29.35 
 
 		 458 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  27.14 
 
 		 451 aa  124  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  27.29 
 
 		 489 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  25.2 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  27.64 
 
 		 485 aa  122  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  27.86 
 
 		 484 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  27.14 
 
 		 446 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  27.14 
 
 		 446 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  27.86 
 
 		 467 aa  121  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 411 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  29.07 
 
 		 482 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 478 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  26.42 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  27.91 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  26.26 
 
 		 458 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  27.92 
 
 		 458 aa  119  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  26.79 
 
 		 494 aa  119  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  28.49 
 
 		 472 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  25.05 
 
 		 439 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 		 427 aa  118  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  28.93 
 
 		 466 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  27.08 
 
 		 448 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  24.95 
 
 		 470 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  27.88 
 
 		 462 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  23.84 
 
 		 470 aa  117  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.06 
 
 		 451 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  25 
 
 		 446 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  28.75 
 
 		 443 aa  117  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  25.51 
 
 		 451 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  26.98 
 
 		 463 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  25.7 
 
 		 449 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  24.35 
 
 		 467 aa  116  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  27.29 
 
 		 479 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  25.87 
 
 		 444 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  25 
 
 		 478 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  27.87 
 
 		 419 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  26.76 
 
 		 494 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  28.8 
 
 		 453 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  25.71 
 
 		 451 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  25.1 
 
 		 909 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  25.15 
 
 		 469 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  24.6 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  28.05 
 
 		 437 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  26.78 
 
 		 456 aa  115  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  26.87 
 
 		 487 aa  115  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  26.78 
 
 		 452 aa  115  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  27.33 
 
 		 440 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  28.13 
 
 		 463 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 413 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  26.02 
 
 		 443 aa  114  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  27.52 
 
 		 478 aa  114  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  26.09 
 
 		 463 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  25.87 
 
 		 451 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  27.62 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>