More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1652 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
119 aa  237  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  78.81 
 
 
135 aa  186  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  76.27 
 
 
130 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  76.27 
 
 
119 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  74.58 
 
 
128 aa  184  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  76.27 
 
 
119 aa  183  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  72.03 
 
 
119 aa  173  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9483e-13  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  62.83 
 
 
120 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  61.06 
 
 
120 aa  139  1e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  63.56 
 
 
117 aa  129  1e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  73.49 
 
 
105 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  42.24 
 
 
125 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 
124 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
112 aa  83.2  1e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 
115 aa  82.4  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
116 aa  82.8  2e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
116 aa  82  2e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
126 aa  82  3e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.12 
 
 
125 aa  80.1  9e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
125 aa  80.1  1e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
132 aa  79  2e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
120 aa  79.3  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 
124 aa  79  2e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
137 aa  78.6  3e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
125 aa  77.4  5e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.12185e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 
183 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
136 aa  75.9  2e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  43.27 
 
 
122 aa  75.1  3e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 
123 aa  74.7  4e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.74 
 
 
127 aa  74.7  4e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
129 aa  73.9  7e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
119 aa  73.9  7e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
120 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
126 aa  72.8  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.62014e-14  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
104 aa  72.8  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
95 aa  72.4  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
131 aa  72.4  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
120 aa  71.6  3e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
126 aa  70.5  8e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
121 aa  70.1  1e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 
120 aa  69.7  1e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
120 aa  68.6  3e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
116 aa  68.6  3e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
119 aa  68.2  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 
105 aa  67.8  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 
121 aa  68.2  4e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
127 aa  68.2  4e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  44 
 
 
336 aa  68.2  4e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
127 aa  67.8  5e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
337 aa  67.4  7e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
127 aa  66.2  1e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
337 aa  65.5  2e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
347 aa  65.9  2e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
117 aa  65.5  2e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
113 aa  65.1  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 
112 aa  65.1  3e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
349 aa  64.3  5e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
109 aa  62.8  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
125 aa  62  3e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
341 aa  60.1  9e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
124 aa  59.7  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
113 aa  58.2  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  36.46 
 
 
118 aa  57  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
116 aa  57  9e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
118 aa  57  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.82 
 
 
107 aa  57  9e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.82 
 
 
107 aa  57  9e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
110 aa  55.5  2e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
291 aa  55.8  2e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
106 aa  55.5  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
120 aa  55.5  2e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
109 aa  56.2  2e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
270 aa  55.8  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
118 aa  55.5  2e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 
109 aa  55.8  2e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 
120 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
126 aa  55.5  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  2.69044e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 
116 aa  55.5  3e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
105 aa  55.5  3e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 
131 aa  55.1  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
108 aa  55.1  3e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
124 aa  55.1  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
297 aa  55.1  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
110 aa  54.7  4e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
113 aa  54.7  4e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  35.42 
 
 
130 aa  54.3  5e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 
102 aa  54.3  5e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
270 aa  54.3  6e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
111 aa  54.3  6e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
95 aa  53.9  7e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.41473e-11  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
95 aa  53.9  7e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.26178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 
110 aa  53.5  8e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>