289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1638 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
367 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  81.84 
 
 
361 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  72.98 
 
 
356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  72.7 
 
 
356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  72.7 
 
 
356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  70.03 
 
 
368 aa  484  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  57.49 
 
 
389 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  48.64 
 
 
376 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  52.22 
 
 
349 aa  299  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  49.14 
 
 
364 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  51.06 
 
 
369 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.14 
 
 
409 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  49.45 
 
 
368 aa  259  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.12 
 
 
369 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  46.45 
 
 
343 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.38 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.94 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  45.37 
 
 
344 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.32 
 
 
360 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  46.15 
 
 
340 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  44.28 
 
 
328 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  43.22 
 
 
328 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  44.67 
 
 
352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  43.08 
 
 
335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  39.94 
 
 
389 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  42.01 
 
 
396 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  42.19 
 
 
369 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  42.29 
 
 
379 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.25 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  42.77 
 
 
361 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  42.11 
 
 
399 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.61 
 
 
324 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.23 
 
 
352 aa  186  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  41.52 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  41.14 
 
 
386 aa  175  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  34.2 
 
 
369 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  30.13 
 
 
342 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  33.02 
 
 
336 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  30.6 
 
 
325 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.91 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.91 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.67 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.45 
 
 
309 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  31.15 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.22 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.74 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  33.02 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  30.96 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.6 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  28.42 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.76 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  29.29 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  29.03 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  30.61 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  27.75 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.04 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.59 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  29.52 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  26.16 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.84 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.73 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  26.87 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  24.45 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.13 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  27 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.54 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  26.45 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.74 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.18 
 
 
293 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2576  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.89 
 
 
364 aa  63.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213671  normal  0.0237764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.27 
 
 
369 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.21 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  23.43 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.64 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  27.36 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5194  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.51 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  26.36 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.47 
 
 
292 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5101  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.75 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.54 
 
 
390 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.39 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  24.84 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  24.11 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.11 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0806  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.89 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000414833  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.54 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3801  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 
364 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.785369  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3619  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3501  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.72 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.05 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  27.81 
 
 
327 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  37.23 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0617  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  37.76 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0833  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.75 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00162887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.12 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  26.4 
 
 
280 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>