43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1538 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  87.35 
 
 
330 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  78.84 
 
 
338 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  79.13 
 
 
338 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  79.13 
 
 
338 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  76.05 
 
 
334 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  56.96 
 
 
320 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  56.15 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  55.83 
 
 
329 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  53.44 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  54.84 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  44.08 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  47.7 
 
 
295 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  44.79 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  34.31 
 
 
135 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  30.67 
 
 
165 aa  63.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  27.34 
 
 
165 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.61 
 
 
142 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  35.29 
 
 
141 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  28.68 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  33.94 
 
 
121 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.31 
 
 
134 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.24 
 
 
178 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  33.93 
 
 
123 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.67 
 
 
128 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.73 
 
 
148 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  29.9 
 
 
141 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  32.88 
 
 
177 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  33.65 
 
 
129 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  28.44 
 
 
130 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  28.72 
 
 
130 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.89 
 
 
130 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  30.39 
 
 
131 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  29.36 
 
 
123 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  30.97 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.07 
 
 
138 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  27.36 
 
 
130 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  27.05 
 
 
189 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  31.13 
 
 
119 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.93 
 
 
130 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  25.44 
 
 
144 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>