149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1468 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  358  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  73.8 
 
 		 187 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  62.87 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  59.77 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.76 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 		 205 aa  87.8  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.05 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 231 aa  72  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  39.29 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  39.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  39.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  25.45 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  36.59 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5275  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.398681  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  42.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  29.11 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  25.53 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>