46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1268 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  91.89 
 
 		 185 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  91.89 
 
 		 185 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  91.89 
 
 		 185 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  68.65 
 
 		 185 aa  276  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  66.49 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  64.32 
 
 		 185 aa  256  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  36.52 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  37.64 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  40.61 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  37.28 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  32.76 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  34.85 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.93 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.58 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  36.43 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  34.42 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  30.08 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  30.3 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  30.46 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  32.61 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.65 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.8 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  28.81 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  29.51 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  25.64 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  28.91 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  43.1 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  31.72 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.41 
 
 		 450 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  33.04 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  26.67 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  26.87 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  31.71 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  28.15 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  28.77 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  36.51 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  26.28 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>