47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1248 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1248  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0560994  decreased coverage  1.50811e-06 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5553  hypothetical protein  80.84 
 
 
215 aa  357  1e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2738  hypothetical protein  56.28 
 
 
223 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526378  normal  0.0730468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2708  hypothetical protein  56.28 
 
 
223 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2752  hypothetical protein  56.28 
 
 
223 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  46.89 
 
 
187 aa  161  8e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  35 
 
 
218 aa  68.2  9e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
219 aa  57.8  1e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
206 aa  48.1  9e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
299 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.09 
 
 
243 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
369 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2615  hypothetical protein  39.44 
 
 
106 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.35 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.15 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.78 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  34.71 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.36 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.71 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.26138e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
369 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
238 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.26 
 
 
228 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  35.14 
 
 
251 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.14 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  55.56 
 
 
217 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  35.14 
 
 
251 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.14 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.14 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.14 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.14 
 
 
251 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.14 
 
 
257 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  40 
 
 
237 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 
195 aa  42  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
212 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.14 
 
 
260 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
205 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
297 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.66 
 
 
236 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>