More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1244 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  100 
 
 
513 aa  1029  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.42825e-07  decreased coverage  2.88489e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  64.43 
 
 
516 aa  666  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  87.62 
 
 
510 aa  917  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  92.13 
 
 
510 aa  953  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  87.62 
 
 
510 aa  920  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  87.62 
 
 
510 aa  920  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  62.58 
 
 
474 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  49.9 
 
 
527 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  47.55 
 
 
504 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  32.87 
 
 
483 aa  285  2e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 
467 aa  275  2e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 
484 aa  263  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 
464 aa  252  9e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
479 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
479 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  39.72 
 
 
497 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.32 
 
 
485 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  33.7 
 
 
484 aa  244  2e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  4.91134e-07  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  34.29 
 
 
516 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 
485 aa  233  8e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 
495 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  33.93 
 
 
488 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 
509 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  35.57 
 
 
497 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 
491 aa  213  5e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 
496 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 
498 aa  206  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 
493 aa  199  8e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  31.45 
 
 
486 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 
485 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 
490 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 
485 aa  186  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  34.69 
 
 
483 aa  186  1e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 
492 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  27.04 
 
 
481 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 
509 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 
510 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 
486 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 
487 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 
502 aa  154  3e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  9.63226e-06  hitchhiker  9.95055e-10 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 
504 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 
461 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 
469 aa  115  1e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 
511 aa  115  2e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 
502 aa  112  1e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 
507 aa  112  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 
507 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 
502 aa  111  4e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 
475 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 
490 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
492 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 
492 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 
492 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 
501 aa  94.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.27 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 
486 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 
491 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
459 aa  86.3  1e-15  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
441 aa  86.3  1e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
506 aa  84.3  4e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 
521 aa  84  6e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26 
 
 
449 aa  84  7e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 
454 aa  83.6  9e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.25 
 
 
449 aa  82.8  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  27.72 
 
 
489 aa  82  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 
450 aa  81.6  3e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  23.98 
 
 
440 aa  81.6  3e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  25.88 
 
 
448 aa  80.9  5e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.32 
 
 
440 aa  80.5  7e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  26.87 
 
 
443 aa  80.1  9e-14  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
449 aa  79.7  1e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 
440 aa  78.6  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 
462 aa  79  2e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 
482 aa  79  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
506 aa  77.8  4e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 
495 aa  77.4  6e-13  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
497 aa  75.9  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
494 aa  75.5  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  22.77 
 
 
460 aa  74.7  4e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.42 
 
 
460 aa  73.9  6e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.88 
 
 
465 aa  73.6  9e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  9.06997e-06 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  22.98 
 
 
473 aa  72.4  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.86 
 
 
489 aa  72  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  24.26 
 
 
480 aa  72.4  2e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  22.98 
 
 
473 aa  72.4  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 
538 aa  71.6  3e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.88 
 
 
463 aa  71.6  3e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 
473 aa  71.2  4e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  22.47 
 
 
456 aa  70.9  5e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
499 aa  70.5  6e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
539 aa  70.9  6e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
499 aa  70.5  7e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 
526 aa  70.5  7e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  22.6 
 
 
447 aa  70.1  8e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  1.24915e-08 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 
447 aa  69.7  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 
517 aa  68.9  2e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  22.6 
 
 
447 aa  69.3  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  22.6 
 
 
447 aa  69.3  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
455 aa  68.9  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 
450 aa  68.2  3e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>