More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1243 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0187  aminotransferase  86.08 
 
 
425 aa  759  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0207  aminotransferase  86.08 
 
 
425 aa  760  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5565  aminotransferase class-III  96.95 
 
 
426 aa  855  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1243  aminotransferase class-III  100 
 
 
426 aa  877  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  2.10523e-06  hitchhiker  1.2077e-05 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0198  aminotransferase  86.08 
 
 
425 aa  760  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0659  aminotransferase class-III  60.09 
 
 
428 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2247  putative aminotransferase  50.12 
 
 
410 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  29.92 
 
 
460 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.03 
 
 
457 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  32.11 
 
 
411 aa  202  1e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  31.95 
 
 
475 aa  201  2e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.25 
 
 
459 aa  200  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  32.13 
 
 
411 aa  197  2e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.46 
 
 
459 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
429 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52781e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
459 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
429 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
429 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.72 
 
 
429 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  32.72 
 
 
429 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  32.72 
 
 
459 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  31 
 
 
475 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  32.72 
 
 
468 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.32 
 
 
477 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3034  aminotransferase  32.08 
 
 
433 aa  185  1e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.96 
 
 
472 aa  184  2e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  4.48411e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.19 
 
 
472 aa  184  2e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.07 
 
 
477 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0117  aminotransferase class-III  30.08 
 
 
421 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0673472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  29.61 
 
 
467 aa  176  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  33.77 
 
 
457 aa  173  7e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  33.89 
 
 
460 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  29 
 
 
462 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.38 
 
 
397 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  32.78 
 
 
955 aa  166  7e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  33.23 
 
 
395 aa  165  1e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  34.72 
 
 
845 aa  164  2e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.65 
 
 
391 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  30.32 
 
 
462 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  32.99 
 
 
451 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  31.97 
 
 
360 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  30.81 
 
 
477 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  28.02 
 
 
445 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.11 
 
 
406 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  31.87 
 
 
458 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  28.67 
 
 
460 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  1.5302e-12 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  28.68 
 
 
396 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  28.68 
 
 
396 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  31.55 
 
 
403 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1071  aminotransferase class-III  28.68 
 
 
402 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  34.84 
 
 
438 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  28.94 
 
 
468 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  28.49 
 
 
450 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  29.13 
 
 
443 aa  156  5e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  30.05 
 
 
401 aa  157  5e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  31.23 
 
 
477 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  31.25 
 
 
406 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  30.53 
 
 
392 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  31.4 
 
 
440 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  29.37 
 
 
463 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  28.08 
 
 
398 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2818  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  32.26 
 
 
478 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  32.57 
 
 
404 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.09 
 
 
399 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.07 
 
 
375 aa  154  3e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  30.59 
 
 
389 aa  154  3e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  30.59 
 
 
389 aa  154  3e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  30.73 
 
 
400 aa  153  6e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  28.8 
 
 
414 aa  153  6e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  31.11 
 
 
400 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  29.44 
 
 
415 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.23 
 
 
436 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  33.6 
 
 
395 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.88 
 
 
436 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  27.84 
 
 
399 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.96 
 
 
408 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  32.54 
 
 
382 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  32.87 
 
 
396 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  29.47 
 
 
386 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  27.37 
 
 
432 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.15 
 
 
408 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  29.19 
 
 
410 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  30.29 
 
 
397 aa  149  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  25.94 
 
 
398 aa  149  1e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.43 
 
 
399 aa  149  1e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  30.48 
 
 
406 aa  149  1e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.07 
 
 
411 aa  149  1e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.5 
 
 
393 aa  149  1e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  28.83 
 
 
386 aa  149  1e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  29.63 
 
 
463 aa  148  1e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  29.44 
 
 
394 aa  148  2e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  30.21 
 
 
406 aa  148  2e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.21 
 
 
406 aa  148  2e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  30.21 
 
 
406 aa  148  2e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  28.84 
 
 
386 aa  148  2e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  30.21 
 
 
406 aa  148  2e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>