262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1203 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  85.22 
 
 
202 aa  341  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  78.82 
 
 
203 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  78.82 
 
 
203 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  78.82 
 
 
203 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
189 aa  70.1  2e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
196 aa  66.2  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
196 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
196 aa  65.5  5e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
196 aa  65.5  5e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
196 aa  65.5  5e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
235 aa  65.5  6e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.63066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
205 aa  65.1  6e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
196 aa  65.1  6e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
196 aa  64.7  9e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.08 
 
 
196 aa  62.8  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 
196 aa  62.8  4e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 
223 aa  62  5e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 
200 aa  62.4  5e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 
236 aa  62  6e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  25.76 
 
 
196 aa  62  6e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  26.26 
 
 
196 aa  61.6  8e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.32 
 
 
200 aa  61.6  8e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.32 
 
 
200 aa  61.6  8e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.02 
 
 
427 aa  60.8  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
200 aa  60.1  2e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.32 
 
 
200 aa  60.1  2e-08  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
412 aa  60.5  2e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 
206 aa  58.5  6e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.91 
 
 
442 aa  58.2  7e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
220 aa  58.2  8e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.88 
 
 
442 aa  58.2  8e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.73 
 
 
222 aa  58.2  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
222 aa  58.2  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
217 aa  57.8  1e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  24.69 
 
 
212 aa  57.8  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.36 
 
 
442 aa  57.4  2e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
215 aa  57  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
215 aa  57  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 
215 aa  57  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 
211 aa  57  2e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
215 aa  57  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 
201 aa  57  2e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 
201 aa  57  2e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 
215 aa  57  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 
232 aa  56.6  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  32.35 
 
 
439 aa  56.6  3e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 
213 aa  56.2  3e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
198 aa  55.5  6e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  28.24 
 
 
219 aa  55.1  6e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
234 aa  55.5  6e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.07 
 
 
369 aa  54.7  9e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  22.67 
 
 
228 aa  54.7  9e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
210 aa  53.9  1e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 
227 aa  54.7  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
209 aa  53.9  2e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  28.28 
 
 
272 aa  53.9  2e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
214 aa  53.5  2e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  28 
 
 
236 aa  53.1  3e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 
212 aa  53.1  3e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 
211 aa  52.4  4e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  30.73 
 
 
208 aa  52.8  4e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 
199 aa  52.4  5e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 
236 aa  52.4  5e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  26.55 
 
 
236 aa  52  5e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.55 
 
 
236 aa  52.4  5e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.88 
 
 
208 aa  52  6e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.35031e-07  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
445 aa  52  6e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
213 aa  51.6  7e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  51.6  7e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 
236 aa  51.6  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
215 aa  51.6  8e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 
205 aa  50.8  1e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 
382 aa  51.2  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.68 
 
 
236 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
203 aa  51.2  1e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
190 aa  51.2  1e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 
288 aa  50.8  1e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 
207 aa  50.1  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 
233 aa  50.4  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  32.73 
 
 
224 aa  50.1  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
240 aa  50.1  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
212 aa  50.4  2e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.26 
 
 
201 aa  49.3  3e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  22.58 
 
 
201 aa  49.7  3e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.55 
 
 
442 aa  49.3  3e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
224 aa  49.7  3e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
286 aa  49.3  3e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.17 
 
 
440 aa  49.7  3e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
236 aa  49.3  4e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
210 aa  49.3  4e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
200 aa  48.9  4e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
234 aa  48.9  5e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
200 aa  48.9  5e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  28.65 
 
 
198 aa  48.9  5e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
207 aa  48.9  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  32.23 
 
 
209 aa  48.9  6e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
197 aa  48.5  6e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 
224 aa  48.5  6e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>