More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1142 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 409 aa  794    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  81.64 
 
 		 306 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  77.59 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  77.59 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  77.59 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  59.11 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  52.8 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  53.45 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  52.92 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  53.42 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.92 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  49.51 
 
 		 307 aa  282  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.17 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.39 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  48.71 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  45.66 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.03 
 
 		 393 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.92 
 
 		 509 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.78 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.7 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.8 
 
 		 504 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  40.77 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.8 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.1 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.88 
 
 		 296 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.33 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.83 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.62 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.97 
 
 		 512 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.21 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.42 
 
 		 549 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.16 
 
 		 625 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.73 
 
 		 303 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  40.98 
 
 		 363 aa  163  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.21 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.86 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.94 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.14 
 
 		 545 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.85 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.11 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.76 
 
 		 732 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13874  transcriptional regulator  66.39 
 
 		 137 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0355258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.17 
 
 		 506 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  35.83 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.53 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.75 
 
 		 560 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.26 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  31.02 
 
 		 530 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  37.11 
 
 		 497 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.23 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.92 
 
 		 493 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.24 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  34.98 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32 
 
 		 618 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  35.88 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.81 
 
 		 493 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.74 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.29 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.53 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.84 
 
 		 619 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.56 
 
 		 516 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.75 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.2 
 
 		 584 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.88 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.55 
 
 		 520 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  36.23 
 
 		 676 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.1 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.4 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.14 
 
 		 538 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.16 
 
 		 374 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.16 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.89 
 
 		 520 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.55 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.58 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.67 
 
 		 563 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.61 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  32.54 
 
 		 684 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.05 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.27 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  28.99 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.8 
 
 		 1336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 		 701 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 		 699 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 		 699 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.67 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.98 
 
 		 734 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 649 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.9 
 
 		 526 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.02 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>