148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1057 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  98.14 
 
 
484 aa  936    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1149    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  45.61 
 
 
511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  45.61 
 
 
488 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  43.82 
 
 
473 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  41.5 
 
 
464 aa  237  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  39.23 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  39.47 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  39.47 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  33.21 
 
 
546 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  34.39 
 
 
535 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  34.38 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  34.49 
 
 
508 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  34.49 
 
 
508 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  42.98 
 
 
441 aa  190  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  34.32 
 
 
514 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  34.77 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  37.61 
 
 
519 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  32.32 
 
 
506 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  34.53 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  38.15 
 
 
550 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  34.57 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  34.57 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  35.22 
 
 
517 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  34.57 
 
 
516 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  34.11 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  34.35 
 
 
491 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  34.35 
 
 
491 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  34.13 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  30.24 
 
 
539 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  32.14 
 
 
579 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  33.56 
 
 
519 aa  143  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  30.12 
 
 
516 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  30.96 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  46.94 
 
 
581 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  46.94 
 
 
581 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  46.26 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  46.26 
 
 
593 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  46.26 
 
 
593 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  46.26 
 
 
578 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  46.94 
 
 
578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  46.94 
 
 
578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  56.31 
 
 
532 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  55.34 
 
 
601 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  54.37 
 
 
571 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  37.56 
 
 
593 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  34.55 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  33.86 
 
 
618 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  53.4 
 
 
601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  31.57 
 
 
551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  53.4 
 
 
586 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  53.4 
 
 
582 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  31.85 
 
 
499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  30.1 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  32.02 
 
 
535 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  32.3 
 
 
580 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.12 
 
 
567 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  30.1 
 
 
566 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  46.05 
 
 
620 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  32.34 
 
 
516 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  28.9 
 
 
512 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  29.68 
 
 
620 aa  104  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.83 
 
 
510 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.04 
 
 
426 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30.34 
 
 
637 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  32.58 
 
 
568 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.57 
 
 
443 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  39.49 
 
 
748 aa  97.4  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.09 
 
 
558 aa  94.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  28.18 
 
 
585 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.09 
 
 
443 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  36.78 
 
 
628 aa  87  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  40.56 
 
 
198 aa  86.7  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  39.72 
 
 
620 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  27.38 
 
 
507 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.76 
 
 
709 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  38.41 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  43 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.59 
 
 
605 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  37.33 
 
 
169 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  27.69 
 
 
556 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.36 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  46.3 
 
 
602 aa  77  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.09 
 
 
714 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  29.24 
 
 
498 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  40.4 
 
 
572 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  40.4 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.8 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  40.4 
 
 
602 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  40.16 
 
 
521 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  41.86 
 
 
586 aa  71.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  33.33 
 
 
743 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  26.59 
 
 
502 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  40.32 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  40.32 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  44.21 
 
 
635 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  26.38 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  39.8 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  26.69 
 
 
577 aa  67  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  30.72 
 
 
427 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>