More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0930 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.09 
 
 
279 aa  474  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.2 
 
 
279 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.48 
 
 
278 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0773345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
280 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  45.26 
 
 
278 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  47.12 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
282 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  45.32 
 
 
280 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 
284 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 
286 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
282 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
276 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
286 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  42.24 
 
 
276 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
288 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
279 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  40.79 
 
 
276 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
276 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
282 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 
277 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
276 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
286 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
284 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  40.33 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
279 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
277 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
281 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.09 
 
 
282 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
282 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
279 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 
282 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
282 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
290 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
285 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
287 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
276 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 
277 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
274 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
280 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
303 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  38.83 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
279 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
295 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
281 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
272 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
276 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
276 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
290 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
290 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
279 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
272 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
274 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
280 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 
287 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
277 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
274 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
274 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
273 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
299 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
274 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
274 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  38.63 
 
 
274 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  37.08 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
290 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
293 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  37.08 
 
 
277 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
284 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  37.08 
 
 
277 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
279 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
273 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
275 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
283 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
296 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
258 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>