More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0899 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
371 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  82.8 
 
 
393 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  81.87 
 
 
371 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  81.87 
 
 
371 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  81.67 
 
 
368 aa  614  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  78.86 
 
 
369 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  78.86 
 
 
369 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  78.86 
 
 
369 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  69.48 
 
 
372 aa  511  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2603  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  68.53 
 
 
378 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  68.14 
 
 
379 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  63.1 
 
 
388 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4585  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.44 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7558  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2310  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  63.83 
 
 
335 aa  411  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  44.85 
 
 
756 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2436  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  42.76 
 
 
344 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2021  cysteine synthase  38.38 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
547 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2157  cysteine synthase  38.38 
 
 
375 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2001  cysteine synthase  38.38 
 
 
375 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2561  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  36.49 
 
 
354 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2508  cysteine synthase  35.46 
 
 
354 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2123  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  36.49 
 
 
354 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1397  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  36.49 
 
 
354 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2647  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  36.49 
 
 
336 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1621  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  36.49 
 
 
336 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3191  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  36.49 
 
 
336 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  36.27 
 
 
340 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  37.83 
 
 
341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.56 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.56 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1970  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  35.97 
 
 
336 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0655  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.7 
 
 
335 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766039  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  36.54 
 
 
338 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.71 
 
 
363 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.24 
 
 
333 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.45 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  37.34 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  31.76 
 
 
305 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  34.16 
 
 
707 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.93 
 
 
459 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  32.51 
 
 
459 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.69 
 
 
330 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  30.29 
 
 
372 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  34.22 
 
 
332 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  39.02 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.51 
 
 
459 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  30.94 
 
 
325 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  34.32 
 
 
312 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  34.32 
 
 
312 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.2 
 
 
459 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  36.68 
 
 
351 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  31 
 
 
304 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.75 
 
 
685 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.12 
 
 
346 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.31 
 
 
333 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  32.08 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  34.44 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  34.49 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.43 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  31.06 
 
 
340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  32.33 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  32.13 
 
 
345 aa  145  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.17 
 
 
330 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  33.22 
 
 
311 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  31.53 
 
 
458 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  33.11 
 
 
301 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  35.25 
 
 
305 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  33.33 
 
 
320 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  34.11 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  34.7 
 
 
336 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  33.22 
 
 
323 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 
364 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.43 
 
 
456 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  34.67 
 
 
455 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  33.33 
 
 
305 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.89 
 
 
304 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  33.65 
 
 
454 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  32.48 
 
 
315 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  32.91 
 
 
456 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  34.06 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  36.18 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  33.73 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  38.24 
 
 
321 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  31.31 
 
 
321 aa  136  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  30.9 
 
 
302 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.42 
 
 
307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  32.33 
 
 
302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  36.36 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  30.46 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  33.89 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  33.33 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3903  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.03 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  35.77 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  31.06 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  36.79 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.76 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  33.11 
 
 
305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  33.02 
 
 
459 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  34.53 
 
 
308 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>