More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0888 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  100 
 
 		 363 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  81.54 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  68.41 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  68.41 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  60.56 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  65.01 
 
 		 370 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  64.86 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  64.56 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  64.56 
 
 		 348 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  64.26 
 
 		 348 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  55.65 
 
 		 372 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  55.65 
 
 		 372 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  55.37 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  53.1 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  52.52 
 
 		 378 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  52.27 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  41.14 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.19 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  56.03 
 
 		 232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  33.12 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  30.79 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  51.85 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.94 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  31.92 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  56.57 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  48.79 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  48.79 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  48.31 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  33.13 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  47.83 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  55.67 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  27.7 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.34 
 
 		 235 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  27.62 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.23 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 173 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.4 
 
 		 350 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  44.02 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  26.59 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  44.34 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  44.86 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  28.92 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 452 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.72 
 
 		 438 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.66 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.5 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  29.47 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  28.41 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  42 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.79 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 859 aa  93.2  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 162 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 188 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.63 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.67 
 
 		 281 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 160 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.2 
 
 		 222 aa  89.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 298 aa  89.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 265 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 173 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 224 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  46.6 
 
 		 226 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  46.6 
 
 		 225 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.71 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  35.21 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 224 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 218 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 		 221 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.47 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 218 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 218 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  35.21 
 
 		 218 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  29.08 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 223 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 223 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>