More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0859 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 
217 aa  443  1e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  77.31 
 
 
221 aa  313  1e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  60.93 
 
 
244 aa  272  2e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  62.33 
 
 
220 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  62.33 
 
 
220 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
220 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
235 aa  117  2e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 
273 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  30.56 
 
 
222 aa  82.8  4e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
221 aa  81.3  1e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
233 aa  75.9  4e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  34.32 
 
 
222 aa  72.8  3e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
231 aa  72.8  4e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
222 aa  68.9  6e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
233 aa  68.2  1e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
234 aa  67.8  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
230 aa  67.8  1e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
396 aa  67  2e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
229 aa  66.2  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
226 aa  65.9  4e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
241 aa  65.5  6e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  29.38 
 
 
224 aa  65.1  8e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 
221 aa  63.5  2e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.28211e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 
229 aa  63.5  2e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 
242 aa  63.9  2e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
241 aa  63.2  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
219 aa  63.2  3e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
234 aa  62.8  3e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 
217 aa  63.2  3e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
219 aa  63.2  3e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
222 aa  62.8  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
234 aa  62.8  4e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 
245 aa  62.4  5e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
227 aa  62.4  5e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
219 aa  62  6e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
246 aa  62  7e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
241 aa  60.8  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 
258 aa  60.8  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
218 aa  60.8  1e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
242 aa  60.5  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
239 aa  60.5  2e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
209 aa  60.1  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  60.5  2e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
213 aa  60.5  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
229 aa  60.5  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
229 aa  60.5  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
230 aa  59.7  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
213 aa  59.7  3e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 
231 aa  59.7  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
222 aa  60.1  3e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
245 aa  59.7  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  2.05206e-06  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
235 aa  60.1  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
216 aa  59.3  4e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
231 aa  59.7  4e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
239 aa  59.3  5e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
235 aa  58.9  5e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
229 aa  58.9  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
219 aa  58.9  6e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  6.4922e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
255 aa  58.9  6e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  28.18 
 
 
230 aa  58.5  7e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
231 aa  58.5  7e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.18605e-05  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
221 aa  58.5  8e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  1.09727e-07 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
222 aa  58.5  8e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  28.02 
 
 
231 aa  58.5  8e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
239 aa  58.2  9e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
242 aa  57.8  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
221 aa  57.8  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
217 aa  57.8  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 
231 aa  57.4  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
231 aa  57.8  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 
236 aa  56.6  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 
238 aa  57.4  2e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.03 
 
 
224 aa  57.4  2e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
235 aa  57  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
241 aa  57  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 
227 aa  57  2e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
226 aa  56.6  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
247 aa  56.6  3e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
214 aa  56.2  3e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
214 aa  56.6  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
230 aa  56.2  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
234 aa  56.6  3e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
222 aa  56.6  3e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
229 aa  56.6  3e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
226 aa  56.6  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
243 aa  56.2  4e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 
257 aa  55.8  4e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1564  transcriptional regulator, GntR family  47.46 
 
 
238 aa  56.2  4e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.23193e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.67 
 
 
251 aa  55.8  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
211 aa  55.8  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 
251 aa  55.5  5e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
225 aa  55.5  5e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 
226 aa  55.8  5e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.81506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
261 aa  55.8  5e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.86795e-06  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
232 aa  55.5  6e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 
226 aa  55.5  6e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  29.48 
 
 
229 aa  55.5  6e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>