More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0857 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  88.89 
 
 
243 aa  437  1e-122  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  82.85 
 
 
247 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  83.26 
 
 
247 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  82.85 
 
 
247 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  72.5 
 
 
249 aa  358  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  70.59 
 
 
245 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.66476e-11 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.34 
 
 
510 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.42 
 
 
516 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.34 
 
 
502 aa  288  5e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  60.08 
 
 
507 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  60.92 
 
 
260 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.07 
 
 
255 aa  278  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
242 aa  276  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6676e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.09 
 
 
247 aa  273  2e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.32 
 
 
246 aa  272  4e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.23 
 
 
242 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.27 
 
 
242 aa  270  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.39 
 
 
246 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.32 
 
 
240 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.17 
 
 
244 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.85 
 
 
242 aa  268  8e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  55.32 
 
 
242 aa  266  3e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.88 
 
 
242 aa  265  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.77 
 
 
240 aa  264  9e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  51.46 
 
 
240 aa  264  9e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
241 aa  263  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.58421e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
242 aa  263  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  50.63 
 
 
255 aa  263  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.66 
 
 
241 aa  262  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.66 
 
 
241 aa  262  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
241 aa  262  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.39 
 
 
253 aa  262  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  54.7 
 
 
241 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  55.23 
 
 
261 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  54.66 
 
 
241 aa  261  5e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.04 
 
 
246 aa  261  5e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.63 
 
 
240 aa  261  5e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.46147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
244 aa  261  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 
240 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.14 
 
 
240 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.88 
 
 
249 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  57.58 
 
 
246 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.58 
 
 
246 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  57.2 
 
 
252 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
270 aa  260  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  58.01 
 
 
246 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  56.09 
 
 
246 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 
273 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
269 aa  258  5e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.3 
 
 
243 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 
251 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.48 
 
 
242 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 
251 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.08614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  55.22 
 
 
255 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.04 
 
 
244 aa  258  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  53.14 
 
 
240 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.5555e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.26 
 
 
240 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  55.19 
 
 
257 aa  257  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
257 aa  257  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.91 
 
 
244 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  54.35 
 
 
248 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.7 
 
 
249 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.51 
 
 
246 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 
244 aa  256  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  54.17 
 
 
242 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.17 
 
 
254 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.17 
 
 
254 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.52 
 
 
243 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.96 
 
 
243 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  52.92 
 
 
241 aa  256  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
249 aa  255  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.3 
 
 
244 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  51.88 
 
 
243 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  49.59 
 
 
269 aa  255  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.36 
 
 
244 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.1 
 
 
239 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.09698e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  57.39 
 
 
248 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.14 
 
 
247 aa  255  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.53 
 
 
254 aa  255  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 
257 aa  254  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.72 
 
 
246 aa  254  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 
264 aa  254  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  51.88 
 
 
243 aa  254  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.11 
 
 
241 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 
240 aa  253  1e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  50.63 
 
 
242 aa  254  1e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  50.2 
 
 
247 aa  253  1e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.31657e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 
240 aa  253  1e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  50.63 
 
 
242 aa  254  1e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.7 
 
 
241 aa  253  2e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  49.58 
 
 
250 aa  253  2e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.78719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  52.7 
 
 
241 aa  253  2e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.7 
 
 
241 aa  253  2e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
241 aa  253  2e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  54.55 
 
 
243 aa  253  2e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.72 
 
 
241 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  52.72 
 
 
248 aa  252  4e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.4239e-08 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  49.79 
 
 
249 aa  252  4e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.16788e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>