More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0822 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.77 
 
 
640 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
636 aa  636    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52 
 
 
640 aa  673    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  51.35 
 
 
642 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.02 
 
 
637 aa  679    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  50.3 
 
 
654 aa  658    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  52.48 
 
 
638 aa  651    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  49.78 
 
 
649 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  52.41 
 
 
643 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  51.41 
 
 
640 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
640 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  49.93 
 
 
654 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  675    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  51.32 
 
 
650 aa  658    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  53.24 
 
 
635 aa  673    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  50.58 
 
 
656 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  52.83 
 
 
642 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
640 aa  671    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  49.63 
 
 
654 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
640 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  49.63 
 
 
654 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  49.63 
 
 
635 aa  649    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  60.92 
 
 
701 aa  800    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  49.63 
 
 
654 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  66.52 
 
 
661 aa  860    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  52.38 
 
 
645 aa  647    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  52.54 
 
 
633 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.64 
 
 
641 aa  683    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.66 
 
 
644 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  94.52 
 
 
675 aa  1294    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.29 
 
 
665 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  65.17 
 
 
661 aa  871    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  50.96 
 
 
652 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  50.07 
 
 
637 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  61.97 
 
 
695 aa  842    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 
647 aa  645    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  55.32 
 
 
640 aa  697    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  54.77 
 
 
644 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
640 aa  671    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  49.63 
 
 
654 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.99 
 
 
642 aa  654    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  48.4 
 
 
650 aa  643    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
640 aa  671    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  49.03 
 
 
634 aa  639    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.77 
 
 
640 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 
634 aa  673    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  86.37 
 
 
714 aa  1186    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  66.86 
 
 
679 aa  835    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.85 
 
 
640 aa  714    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  50.36 
 
 
675 aa  684    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  49.78 
 
 
653 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  65.78 
 
 
719 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  53.29 
 
 
632 aa  703    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  52.37 
 
 
645 aa  689    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 
646 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  50.97 
 
 
650 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  51.93 
 
 
642 aa  654    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  52.97 
 
 
648 aa  687    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  94.52 
 
 
675 aa  1294    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.19 
 
 
644 aa  746    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  49.1 
 
 
652 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  53 
 
 
638 aa  658    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  52.85 
 
 
638 aa  658    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  61.4 
 
 
720 aa  835    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  67.61 
 
 
652 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  54.18 
 
 
633 aa  678    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  63.65 
 
 
685 aa  819    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  53.18 
 
 
638 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.72 
 
 
633 aa  699    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.65 
 
 
651 aa  671    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  72.53 
 
 
657 aa  979    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
659 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  66.37 
 
 
648 aa  876    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
640 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
635 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  50.81 
 
 
644 aa  663    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  60.83 
 
 
686 aa  766    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  56.05 
 
 
696 aa  765    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54 
 
 
650 aa  679    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  61.81 
 
 
696 aa  839    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.35 
 
 
628 aa  729    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.12 
 
 
643 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  49.33 
 
 
645 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  65.93 
 
 
666 aa  858    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.47 
 
 
633 aa  714    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  49.93 
 
 
654 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  50.6 
 
 
643 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  61.82 
 
 
711 aa  770    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  72.63 
 
 
654 aa  981    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  94.52 
 
 
675 aa  1294    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.64 
 
 
636 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  95.85 
 
 
675 aa  1266    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
675 aa  1385    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  50.81 
 
 
636 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  49.63 
 
 
654 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  50.75 
 
 
651 aa  652    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.12 
 
 
637 aa  693    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.34 
 
 
642 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>